90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0989 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 630 aa  1266    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  26.74 
 
 		 747 aa  200  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0764  phage tail protein  35.93 
 
 		 727 aa  142  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555023  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4353  hypothetical protein  28.85 
 
 		 696 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.218725  normal  0.229302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  37.35 
 
 		 346 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  37.95 
 
 		 354 aa  93.6  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1949  phage tail protein  27.84 
 
 		 676 aa  90.5  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  30.25 
 
 		 831 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3609  phage tail protein  30.61 
 
 		 448 aa  81.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1871  hypothetical protein  29.68 
 
 		 809 aa  78.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0347166  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  28.45 
 
 		 522 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  29.81 
 
 		 668 aa  75.1  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  26.42 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  32.41 
 
 		 930 aa  73.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  28.1 
 
 		 930 aa  73.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  33.52 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.29 
 
 		 1293 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  34.06 
 
 		 903 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  25.46 
 
 		 588 aa  72  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  32.16 
 
 		 579 aa  71.2  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  27.64 
 
 		 676 aa  70.9  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  28.73 
 
 		 709 aa  69.7  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  27.97 
 
 		 752 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1514  phage tail protein  30.7 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1138  phage tail protein  30.96 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  30.88 
 
 		 525 aa  66.6  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1745  phage tail protein  29.49 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  38.83 
 
 		 786 aa  66.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  31.11 
 
 		 1163 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  25.97 
 
 		 700 aa  65.5  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  24.78 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  29.44 
 
 		 1146 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2888  hypothetical protein  30.86 
 
 		 178 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.43 
 
 		 343 aa  62  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  29.09 
 
 		 390 aa  62  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  27.98 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  28.18 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  26.69 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  29.94 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  29.68 
 
 		 1177 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  30.95 
 
 		 627 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  35.38 
 
 		 418 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4393  phage tail protein  30.68 
 
 		 179 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2270  phage tail protein  37.37 
 
 		 179 aa  59.3  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111092  hitchhiker  0.000515874 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  29.11 
 
 		 353 aa  57  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  31.43 
 
 		 1030 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  30.81 
 
 		 1140 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1068 aa  54.7  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 		 683 aa  53.9  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 678 aa  53.5  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 368 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  28.03 
 
 		 319 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  25.29 
 
 		 1750 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  26.57 
 
 		 363 aa  52.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  35.16 
 
 		 315 aa  51.6  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  27.51 
 
 		 354 aa  51.2  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  32.2 
 
 		 347 aa  50.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1416  phage tail protein  34.26 
 
 		 174 aa  50.4  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26620  phage tail protein  30.18 
 
 		 189 aa  50.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.691503 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  22.5 
 
 		 1834 aa  50.4  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  27.69 
 
 		 355 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  30 
 
 		 384 aa  50.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2977  NHL repeat containing protein  27.88 
 
 		 665 aa  50.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0272113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  25.57 
 
 		 405 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2949  phage tail protein  33.98 
 
 		 191 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  30.94 
 
 		 359 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  29.01 
 
 		 365 aa  48.9  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 1079 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3047  phage tail protein  29.78 
 
 		 949 aa  48.5  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000382276 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  26.72 
 
 		 355 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1568  hypothetical protein  28.04 
 
 		 180 aa  48.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475244 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1051 aa  48.1  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  28.15 
 
 		 343 aa  47.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1910  phage tail protein  30.63 
 
 		 179 aa  47.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.162255  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  26.4 
 
 		 646 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  28.21 
 
 		 318 aa  47  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  28.97 
 
 		 373 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  25.93 
 
 		 361 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.82 
 
 		 693 aa  46.2  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 1230 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3826  phage tail protein  33.73 
 
 		 175 aa  45.8  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713673  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  27.49 
 
 		 412 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  26.37 
 
 		 711 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  26.45 
 
 		 343 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0177  NHL repeat containing protein  28.35 
 
 		 716 aa  45.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.49 
 
 		 1292 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  29.37 
 
 		 684 aa  44.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  28.04 
 
 		 652 aa  44.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  26.98 
 
 		 396 aa  44.3  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 		 732 aa  44.3  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>