25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1910 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1910  phage tail protein  100 
 
 		 179 aa  357  7e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.162255  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0922  phage tail protein  47.95 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.153076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3826  phage tail protein  47.43 
 
 		 175 aa  144  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713673  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4393  phage tail protein  42.29 
 
 		 179 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2270  phage tail protein  46.31 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111092  hitchhiker  0.000515874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5380  phage tail protein  45 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.885071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2949  phage tail protein  36.93 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  28.93 
 
 		 354 aa  79  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  29.38 
 
 		 346 aa  77.8  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3609  phage tail protein  26.82 
 
 		 448 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1138  phage tail protein  26.79 
 
 		 339 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1416  phage tail protein  29.01 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  32.63 
 
 		 747 aa  63.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1745  phage tail protein  31.18 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26620  phage tail protein  33.96 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.691503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3047  phage tail protein  34.57 
 
 		 949 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000382276 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0764  phage tail protein  25.26 
 
 		 727 aa  53.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555023  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1949  phage tail protein  36.63 
 
 		 676 aa  52.4  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  30.63 
 
 		 630 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2888  hypothetical protein  29.21 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4353  hypothetical protein  28.44 
 
 		 696 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.218725  normal  0.229302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1048  phage tail protein  27.16 
 
 		 263 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0667  phage tail protein  25.93 
 
 		 292 aa  42  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.568288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2883  phage tail protein  27.37 
 
 		 292 aa  42.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1871  hypothetical protein  33.71 
 
 		 809 aa  42.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0347166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>