19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1949 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1949  phage tail protein  100 
 
 
676 aa  1320    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4353  hypothetical protein  31.18 
 
 
696 aa  144  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.218725  normal  0.229302 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  22.38 
 
 
747 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0764  phage tail protein  26.84 
 
 
727 aa  96.7  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555023  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  27.84 
 
 
630 aa  90.5  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1871  hypothetical protein  26.68 
 
 
809 aa  75.1  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0347166  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3047  phage tail protein  28.78 
 
 
949 aa  68.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000382276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  38.24 
 
 
346 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  36.27 
 
 
354 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2949  phage tail protein  38 
 
 
191 aa  58.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0922  phage tail protein  32.24 
 
 
176 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.153076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1910  phage tail protein  36.63 
 
 
179 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.162255  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.48 
 
 
1293 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1745  phage tail protein  33.66 
 
 
404 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1514  phage tail protein  30.88 
 
 
245 aa  48.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3609  phage tail protein  26.48 
 
 
448 aa  48.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1138  phage tail protein  27.41 
 
 
339 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  21.98 
 
 
831 aa  45.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26620  phage tail protein  35.35 
 
 
189 aa  43.9  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.691503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>