23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4353 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4353  hypothetical protein  100 
 
 		 696 aa  1324    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.218725  normal  0.229302 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1949  phage tail protein  31.18 
 
 		 676 aa  144  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0764  phage tail protein  30.24 
 
 		 727 aa  126  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555023  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  29.25 
 
 		 630 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  24.01 
 
 		 747 aa  98.2  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  37.25 
 
 		 354 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  40.71 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3609  phage tail protein  27.14 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1871  hypothetical protein  28.62 
 
 		 809 aa  67.8  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0347166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2949  phage tail protein  29.35 
 
 		 191 aa  62.4  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4393  phage tail protein  28.57 
 
 		 179 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3047  phage tail protein  28.21 
 
 		 949 aa  56.6  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000382276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2270  phage tail protein  33.33 
 
 		 179 aa  54.7  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111092  hitchhiker  0.000515874 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1514  phage tail protein  24.89 
 
 		 245 aa  54.3  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1416  phage tail protein  35.92 
 
 		 174 aa  53.9  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3826  phage tail protein  39.13 
 
 		 175 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713673  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5380  phage tail protein  35 
 
 		 179 aa  47.4  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.885071  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26620  phage tail protein  29.55 
 
 		 189 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.691503 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4340  phage tail protein GpI  34.29 
 
 		 176 aa  45.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.025863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1745  phage tail protein  24.18 
 
 		 404 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3303  phage tail protein I  35.62 
 
 		 225 aa  45.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  29.14 
 
 		 841 aa  44.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3036  tail protein I  34.29 
 
 		 203 aa  43.9  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>