114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1861 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  100 
 
 		 747 aa  1533    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  26.74 
 
 		 630 aa  200  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1949  phage tail protein  22.38 
 
 		 676 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0764  phage tail protein  26.37 
 
 		 727 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555023  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4353  hypothetical protein  24.01 
 
 		 696 aa  98.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.218725  normal  0.229302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  40.71 
 
 		 354 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  29.66 
 
 		 930 aa  84  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  38.18 
 
 		 346 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  30.36 
 
 		 668 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  27.36 
 
 		 588 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  29.96 
 
 		 831 aa  76.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  31.72 
 
 		 930 aa  76.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3609  phage tail protein  28.82 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405055 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  27.41 
 
 		 676 aa  75.5  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  32.32 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  26.43 
 
 		 709 aa  73.9  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  33.55 
 
 		 346 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  33.58 
 
 		 1030 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  27.17 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  26.89 
 
 		 372 aa  72  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  30.08 
 
 		 1293 aa  71.2  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3047  phage tail protein  26.77 
 
 		 949 aa  71.2  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000382276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  28.28 
 
 		 347 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  28.03 
 
 		 491 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.26 
 
 		 1163 aa  68.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  30.04 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  27.31 
 
 		 365 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1146 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.11 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  29.93 
 
 		 1750 aa  65.1  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  29.05 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  28.99 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1138  phage tail protein  26.43 
 
 		 339 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  27.13 
 
 		 355 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1910  phage tail protein  32.63 
 
 		 179 aa  63.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.162255  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3826  phage tail protein  35.29 
 
 		 175 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713673  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  24.65 
 
 		 652 aa  63.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  26.39 
 
 		 579 aa  62.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1514  phage tail protein  21.6 
 
 		 245 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26620  phage tail protein  36.84 
 
 		 189 aa  63.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.691503 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2270  phage tail protein  31.96 
 
 		 179 aa  61.6  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111092  hitchhiker  0.000515874 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  25.37 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  31.71 
 
 		 319 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  26.13 
 
 		 368 aa  60.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  27.98 
 
 		 627 aa  60.1  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  30.07 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  24.55 
 
 		 700 aa  58.5  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  27.45 
 
 		 903 aa  58.5  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  26.91 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  26.9 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2949  phage tail protein  30.69 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  25.42 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  28.87 
 
 		 1068 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  30.18 
 
 		 387 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  28.35 
 
 		 307 aa  57  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  26.99 
 
 		 752 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  27.08 
 
 		 343 aa  56.2  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  29.1 
 
 		 323 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  26.69 
 
 		 363 aa  55.8  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  27.75 
 
 		 384 aa  55.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  28.57 
 
 		 392 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  29.14 
 
 		 318 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  28.89 
 
 		 786 aa  55.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  26.16 
 
 		 318 aa  54.7  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  26.45 
 
 		 1079 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  26.97 
 
 		 353 aa  53.9  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  26.58 
 
 		 321 aa  53.9  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0922  phage tail protein  26.6 
 
 		 176 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.153076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1745  phage tail protein  32.69 
 
 		 404 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1763 aa  52  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1416  phage tail protein  32.23 
 
 		 174 aa  52  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  28.02 
 
 		 395 aa  51.6  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  30.43 
 
 		 390 aa  51.2  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4393  phage tail protein  26.67 
 
 		 179 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0414  NHL repeat containing protein  27.72 
 
 		 803 aa  51.2  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316951  normal  0.387155 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  26.35 
 
 		 646 aa  51.2  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1030 aa  51.2  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  27.43 
 
 		 639 aa  50.8  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  24.2 
 
 		 354 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  24.32 
 
 		 623 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  28.32 
 
 		 1834 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  27.01 
 
 		 418 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  31.85 
 
 		 1026 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  26.15 
 
 		 1140 aa  50.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  27.68 
 
 		 2296 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  26.04 
 
 		 439 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  26.82 
 
 		 364 aa  48.9  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  26.51 
 
 		 328 aa  48.5  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  22.86 
 
 		 732 aa  48.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  24.32 
 
 		 1177 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.82 
 
 		 1130 aa  47.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1051 aa  47.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  28.99 
 
 		 355 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  25.1 
 
 		 343 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  24.48 
 
 		 664 aa  47.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.78 
 
 		 693 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  23.51 
 
 		 711 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  25.15 
 
 		 930 aa  46.2  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 		 863 aa  46.2  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  27.67 
 
 		 326 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>