16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1514 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1514  phage tail protein  100 
 
 
245 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3609  phage tail protein  28.94 
 
 
448 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1745  phage tail protein  31.25 
 
 
404 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1138  phage tail protein  30.36 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  27.57 
 
 
346 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  30.7 
 
 
630 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0764  phage tail protein  25.51 
 
 
727 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555023  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  27.1 
 
 
354 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  21.6 
 
 
747 aa  62.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4353  hypothetical protein  24.89 
 
 
696 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.218725  normal  0.229302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2888  hypothetical protein  26.95 
 
 
178 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2949  phage tail protein  28.57 
 
 
191 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4393  phage tail protein  32.99 
 
 
179 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3826  phage tail protein  29.9 
 
 
175 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713673  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1949  phage tail protein  30.88 
 
 
676 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26620  phage tail protein  28 
 
 
189 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.691503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>