24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3609 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3609  phage tail protein  100 
 
 		 448 aa  900    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405055 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1514  phage tail protein  27.66 
 
 		 245 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  28.67 
 
 		 630 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  33.93 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  34.23 
 
 		 354 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1138  phage tail protein  34.04 
 
 		 339 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  28.82 
 
 		 747 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0764  phage tail protein  27.56 
 
 		 727 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555023  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4353  hypothetical protein  28.57 
 
 		 696 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.218725  normal  0.229302 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1745  phage tail protein  34.62 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1910  phage tail protein  26.82 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.162255  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3826  phage tail protein  32.56 
 
 		 175 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713673  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4393  phage tail protein  33.64 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0922  phage tail protein  34.74 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.153076 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2270  phage tail protein  33.33 
 
 		 179 aa  54.3  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111092  hitchhiker  0.000515874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2949  phage tail protein  33 
 
 		 191 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0750  PASTA domain-containing protein  36.05 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.21 
 
 		 627 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1949  phage tail protein  26.48 
 
 		 676 aa  47.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1368  hypothetical protein  32.39 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  32 
 
 		 621 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2392  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.96 
 
 		 702 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00165759  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  27.33 
 
 		 2397 aa  43.9  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3047  phage tail protein  30.77 
 
 		 949 aa  43.1  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000382276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>