22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1138 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1138  phage tail protein  100 
 
 
339 aa  697    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1745  phage tail protein  35.8 
 
 
404 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  39.22 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  39.22 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3609  phage tail protein  34.04 
 
 
448 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405055 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1514  phage tail protein  30.36 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0922  phage tail protein  25.42 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.153076 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  30.96 
 
 
630 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1910  phage tail protein  26.79 
 
 
179 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.162255  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  26.43 
 
 
747 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2270  phage tail protein  33.7 
 
 
179 aa  62.8  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111092  hitchhiker  0.000515874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4393  phage tail protein  32.29 
 
 
179 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0764  phage tail protein  27.73 
 
 
727 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555023  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26620  phage tail protein  31.78 
 
 
189 aa  53.9  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.691503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1568  hypothetical protein  25.64 
 
 
180 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.475244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2949  phage tail protein  28.87 
 
 
191 aa  49.3  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3047  phage tail protein  31.82 
 
 
949 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000382276 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1416  phage tail protein  29.36 
 
 
174 aa  48.9  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3826  phage tail protein  30.38 
 
 
175 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713673  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2888  hypothetical protein  28.07 
 
 
178 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5380  phage tail protein  31.71 
 
 
179 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.885071  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1949  phage tail protein  27.41 
 
 
676 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>