23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2270 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2270  phage tail protein  100 
 
 
179 aa  346  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111092  hitchhiker  0.000515874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4393  phage tail protein  46.67 
 
 
179 aa  154  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1910  phage tail protein  44.32 
 
 
179 aa  143  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.162255  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3826  phage tail protein  44.83 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713673  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2949  phage tail protein  38.33 
 
 
191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5380  phage tail protein  50.6 
 
 
179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.885071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0922  phage tail protein  31.64 
 
 
176 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.153076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  30.67 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  35.48 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1138  phage tail protein  30.25 
 
 
339 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  28.57 
 
 
747 aa  63.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0764  phage tail protein  32.14 
 
 
727 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555023  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  36.63 
 
 
630 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1416  phage tail protein  30.87 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3609  phage tail protein  32.89 
 
 
448 aa  54.7  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405055 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4353  hypothetical protein  29.83 
 
 
696 aa  54.7  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.218725  normal  0.229302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1048  phage tail protein  28.97 
 
 
263 aa  52.4  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26620  phage tail protein  32.38 
 
 
189 aa  52  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.691503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1745  phage tail protein  28.72 
 
 
404 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3047  phage tail protein  28.57 
 
 
949 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000382276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1949  phage tail protein  32.67 
 
 
676 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2883  phage tail protein  26.49 
 
 
292 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0857  phage tail protein  26.49 
 
 
292 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>