24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4393 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4393  phage tail protein  100 
 
 		 179 aa  350  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1910  phage tail protein  42.29 
 
 		 179 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.162255  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2270  phage tail protein  45.25 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111092  hitchhiker  0.000515874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2949  phage tail protein  42.61 
 
 		 191 aa  124  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3826  phage tail protein  39.55 
 
 		 175 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713673  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0922  phage tail protein  37.5 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.153076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5380  phage tail protein  43.11 
 
 		 179 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.885071  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  26.14 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  27.54 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1745  phage tail protein  35.42 
 
 		 404 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3609  phage tail protein  33.64 
 
 		 448 aa  61.6  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405055 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4353  hypothetical protein  28.57 
 
 		 696 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.218725  normal  0.229302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  30.68 
 
 		 630 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1138  phage tail protein  32.29 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26620  phage tail protein  29.88 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.691503 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0764  phage tail protein  30.21 
 
 		 727 aa  51.6  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555023  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  26.67 
 
 		 747 aa  51.6  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1416  phage tail protein  26.83 
 
 		 174 aa  51.2  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1514  phage tail protein  32.99 
 
 		 245 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2883  phage tail protein  26.52 
 
 		 292 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1048  phage tail protein  33.33 
 
 		 263 aa  45.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0857  phage tail protein  27.62 
 
 		 292 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0667  phage tail protein  25.41 
 
 		 292 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.568288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1949  phage tail protein  28.93 
 
 		 676 aa  42  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>