12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1048 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1048  phage tail protein  100 
 
 		 263 aa  508  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26620  phage tail protein  53.33 
 
 		 189 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.691503 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1416  phage tail protein  53.61 
 
 		 174 aa  167  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3826  phage tail protein  36.67 
 
 		 175 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713673  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  27.18 
 
 		 354 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2949  phage tail protein  31.67 
 
 		 191 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  26.04 
 
 		 747 aa  45.8  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  26.36 
 
 		 346 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4393  phage tail protein  33.33 
 
 		 179 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4353  hypothetical protein  27.59 
 
 		 696 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.218725  normal  0.229302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2270  phage tail protein  28.97 
 
 		 179 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111092  hitchhiker  0.000515874 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1910  phage tail protein  27.16 
 
 		 179 aa  42  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.162255  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>