230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1667 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  100 
 
 
346 aa  686    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  82.47 
 
 
354 aa  546  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  37.13 
 
 
630 aa  95.9  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4353  hypothetical protein  40.71 
 
 
696 aa  86.3  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.218725  normal  0.229302 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  38.18 
 
 
747 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3609  phage tail protein  30.34 
 
 
448 aa  83.2  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405055 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0764  phage tail protein  41.18 
 
 
727 aa  79.3  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555023  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1138  phage tail protein  39.22 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1745  phage tail protein  29.12 
 
 
404 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1910  phage tail protein  29.38 
 
 
179 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.162255  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4393  phage tail protein  27.54 
 
 
179 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3826  phage tail protein  31.21 
 
 
175 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713673  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2270  phage tail protein  34.78 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111092  hitchhiker  0.000515874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2949  phage tail protein  25.47 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  33.75 
 
 
1057 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1514  phage tail protein  27.57 
 
 
245 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1568  hypothetical protein  31.61 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.475244 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1949  phage tail protein  38.24 
 
 
676 aa  67  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2147  FHA domain-containing protein  37.39 
 
 
137 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2888  hypothetical protein  31.9 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  40.21 
 
 
1053 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  43.75 
 
 
1424 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3525  FHA domain-containing protein  39.22 
 
 
139 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.995835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0922  phage tail protein  28.08 
 
 
176 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.153076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.55 
 
 
1004 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40 
 
 
903 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  38.3 
 
 
894 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  41.11 
 
 
894 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3047  phage tail protein  33.96 
 
 
949 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000382276 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  44 
 
 
863 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.24 
 
 
799 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  39.02 
 
 
799 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.82 
 
 
899 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1079  FHA domain containing protein  28.68 
 
 
317 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.153112 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3045  FHA domain-containing protein  31.25 
 
 
174 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000453276  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  40 
 
 
1167 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2775  Forkhead-associated protein  36.25 
 
 
149 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105667  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0024  FHA domain-containing protein  37.37 
 
 
280 aa  57  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1416  phage tail protein  30.91 
 
 
174 aa  57.4  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00230  FHA domain-containing protein  53.73 
 
 
160 aa  57  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.853372  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0132  diguanylate cyclase  31.34 
 
 
289 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508624  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14970  FHA domain-containing protein  38.27 
 
 
152 aa  56.2  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0364194  normal  0.592543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0116  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  31.31 
 
 
219 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2339  FHA domain containing protein  37.04 
 
 
146 aa  56.2  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.53176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  37.36 
 
 
1428 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4010  FHA domain containing protein  35 
 
 
156 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.196899  normal  0.106089 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1226  FHA domain-containing protein  34.94 
 
 
177 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0027  forkhead-associated protein  42.35 
 
 
158 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620379  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0030  FHA domain containing protein  50.7 
 
 
169 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3658  winged helix family two component response transcriptional regulator  30.15 
 
 
220 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26620  phage tail protein  32.35 
 
 
189 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.691503 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0553  FHA domain-containing protein  29.13 
 
 
226 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3135  FHA domain-containing protein  38.27 
 
 
157 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547801  normal  0.0667215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.52 
 
 
890 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3402  FHA domain-containing protein  38.27 
 
 
183 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10779  normal  0.511824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2844  FHA domain-containing protein  38.27 
 
 
158 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2888  FHA domain-containing protein  38.27 
 
 
158 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2875  FHA domain-containing protein  38.27 
 
 
158 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  39.22 
 
 
878 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1468  FHA domain-containing protein  35.8 
 
 
181 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  26.38 
 
 
617 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4997  FHA domain-containing protein  37.04 
 
 
221 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0150  diguanylate cyclase  30.6 
 
 
289 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0139  diguanylate cyclase  30.83 
 
 
289 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03340  FHA domain-containing protein  36.14 
 
 
408 aa  52.8  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0411441  normal  0.659189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1871  hypothetical protein  28.17 
 
 
809 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0347166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1434  FHA domain-containing protein  31.76 
 
 
152 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740529  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00230  FHA domain-containing protein  40.58 
 
 
163 aa  52  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3399  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.35 
 
 
557 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0150052  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  38.1 
 
 
1157 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5380  phage tail protein  32.88 
 
 
179 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.885071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2967  winged helix family two component response transcriptional regulator  32.95 
 
 
218 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2114  FHA domain containing protein  38.89 
 
 
121 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.508953  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6306  FHA domain containing protein  38.03 
 
 
307 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3479  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.03 
 
 
554 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0023  FHA domain containing protein  49.25 
 
 
170 aa  50.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0136  diguanylate cyclase  33.88 
 
 
288 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.041844  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3415  putative sigma54 specific transcriptional regulator  41.03 
 
 
554 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417822  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3733  FHA domain containing protein  34.58 
 
 
172 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  0.0527204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0140  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.93 
 
 
500 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2308  FHA domain-containing protein  32.95 
 
 
149 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0512464  hitchhiker  0.000482709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2434  FHA domain containing protein  32.91 
 
 
178 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00264365  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1693  FHA domain-containing protein  35.53 
 
 
167 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514614  normal  0.923966 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23873  predicted protein  30.43 
 
 
698 aa  50.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  39.77 
 
 
851 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6711  putative sigma54 specific transcriptional regulator  31.13 
 
 
448 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2044  FHA domain containing protein  38.89 
 
 
121 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5627  FHA domain containing protein  32.97 
 
 
767 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.201198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4002  FHA domain-containing protein-like protein  36.71 
 
 
171 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759759  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3125  protein kinase  33.82 
 
 
466 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3146  FHA domain-containing protein  35.51 
 
 
134 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  31.17 
 
 
566 aa  49.7  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13850  FHA domain-containing protein  35.9 
 
 
141 aa  49.7  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4783  FHA domain-containing protein  34.02 
 
 
236 aa  49.3  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1480  winged helix family two component response transcriptional regulator  27.21 
 
 
221 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.723328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3128  FHA domain containing protein  37.5 
 
 
179 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3491  FHA domain containing protein  34.38 
 
 
155 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1797  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
195 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1048  phage tail protein  27.4 
 
 
263 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3184  FHA domain containing protein  30.91 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148023  normal  0.306056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>