25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3826 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3826  phage tail protein  100 
 
 		 175 aa  332  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713673  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1910  phage tail protein  47.43 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.162255  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4393  phage tail protein  39.55 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2270  phage tail protein  46.9 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111092  hitchhiker  0.000515874 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0922  phage tail protein  39.2 
 
 		 176 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.153076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2949  phage tail protein  36 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  29.24 
 
 		 354 aa  85.5  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  29.41 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5380  phage tail protein  40 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.885071  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26620  phage tail protein  34.62 
 
 		 189 aa  70.9  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.691503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3609  phage tail protein  29.41 
 
 		 448 aa  65.1  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405055 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  34.83 
 
 		 747 aa  63.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1416  phage tail protein  31.03 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1138  phage tail protein  29.17 
 
 		 339 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1514  phage tail protein  27.42 
 
 		 245 aa  53.9  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3047  phage tail protein  36.59 
 
 		 949 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000382276 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4353  hypothetical protein  38.36 
 
 		 696 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.218725  normal  0.229302 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1745  phage tail protein  25.51 
 
 		 404 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0764  phage tail protein  27.72 
 
 		 727 aa  51.6  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555023  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1048  phage tail protein  35.11 
 
 		 263 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  29.05 
 
 		 630 aa  47.8  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0667  phage tail protein  26.42 
 
 		 292 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.568288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0857  phage tail protein  26.42 
 
 		 292 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2883  phage tail protein  25.79 
 
 		 292 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1568  hypothetical protein  27.61 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>