22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5380 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5380  phage tail protein  100 
 
 		 179 aa  349  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.885071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1910  phage tail protein  45.03 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.162255  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2949  phage tail protein  44.63 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2270  phage tail protein  46.93 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111092  hitchhiker  0.000515874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4393  phage tail protein  43.75 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0922  phage tail protein  41.99 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.153076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3826  phage tail protein  40.91 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713673  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  30.19 
 
 		 354 aa  71.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0764  phage tail protein  35.05 
 
 		 727 aa  68.9  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555023  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  35.34 
 
 		 346 aa  68.2  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1138  phage tail protein  35.92 
 
 		 339 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1745  phage tail protein  32.14 
 
 		 404 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26620  phage tail protein  31.71 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.691503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3609  phage tail protein  32.71 
 
 		 448 aa  61.6  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  36.36 
 
 		 630 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1514  phage tail protein  28.57 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  28.71 
 
 		 747 aa  55.5  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1416  phage tail protein  29.34 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4353  hypothetical protein  35.35 
 
 		 696 aa  55.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.218725  normal  0.229302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1048  phage tail protein  29.89 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1949  phage tail protein  37.37 
 
 		 676 aa  51.2  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2888  hypothetical protein  32.17 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>