255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2986 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  100 
 
 		 1293 aa  2619    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  44.32 
 
 		 930 aa  452  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  42.27 
 
 		 831 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  46.21 
 
 		 676 aa  444  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  41.47 
 
 		 668 aa  421  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  34.91 
 
 		 588 aa  335  2e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  49.47 
 
 		 346 aa  251  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  46.62 
 
 		 579 aa  249  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  42.31 
 
 		 627 aa  228  8e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  44.44 
 
 		 387 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  42.2 
 
 		 709 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  42.09 
 
 		 343 aa  211  8e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  40.18 
 
 		 522 aa  211  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  39.78 
 
 		 752 aa  208  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  44 
 
 		 930 aa  207  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  42.55 
 
 		 491 aa  206  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  35.97 
 
 		 392 aa  199  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  45.85 
 
 		 390 aa  196  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  31.6 
 
 		 1030 aa  187  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  40.6 
 
 		 391 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2394  von Willebrand factor, type A  42.42 
 
 		 972 aa  177  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.400523  hitchhiker  0.00000432302 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  28.34 
 
 		 963 aa  172  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  28.96 
 
 		 1750 aa  172  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1068 aa  170  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.7 
 
 		 1130 aa  169  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  38.6 
 
 		 786 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  34.49 
 
 		 525 aa  164  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  37.3 
 
 		 1215 aa  160  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  37.3 
 
 		 1215 aa  160  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  38.63 
 
 		 1146 aa  160  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  36.9 
 
 		 1215 aa  159  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.51 
 
 		 1215 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  36.51 
 
 		 1215 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 1230 aa  152  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  29.71 
 
 		 1026 aa  149  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  35.65 
 
 		 1163 aa  145  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.41 
 
 		 1292 aa  144  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  34.22 
 
 		 319 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  31.23 
 
 		 1079 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  33.11 
 
 		 1177 aa  133  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  35.18 
 
 		 1140 aa  128  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  39.23 
 
 		 365 aa  118  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  29.28 
 
 		 307 aa  118  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 		 772 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  30.35 
 
 		 892 aa  117  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  24.64 
 
 		 700 aa  116  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  34.47 
 
 		 359 aa  116  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  29.76 
 
 		 903 aa  116  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  34.1 
 
 		 353 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  33.22 
 
 		 343 aa  115  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  30.17 
 
 		 354 aa  112  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  34.54 
 
 		 368 aa  112  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  29.17 
 
 		 439 aa  110  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  27.34 
 
 		 1834 aa  109  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  33.47 
 
 		 355 aa  109  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  34.58 
 
 		 2296 aa  108  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  37.97 
 
 		 347 aa  105  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  36.09 
 
 		 372 aa  105  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  28.63 
 
 		 363 aa  103  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  31.15 
 
 		 623 aa  103  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  31.62 
 
 		 646 aa  103  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1030 aa  102  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  32.92 
 
 		 732 aa  102  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 284 aa  102  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  26.63 
 
 		 770 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  31.65 
 
 		 322 aa  100  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  30.71 
 
 		 321 aa  100  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  30.24 
 
 		 660 aa  100  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  30.52 
 
 		 328 aa  99.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  28.73 
 
 		 360 aa  99.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 		 850 aa  99.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  27.69 
 
 		 318 aa  99  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  30.31 
 
 		 412 aa  98.6  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  31.53 
 
 		 318 aa  97.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  29.35 
 
 		 326 aa  96.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  28.85 
 
 		 652 aa  96.3  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 		 863 aa  95.9  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  30.19 
 
 		 639 aa  95.5  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  29.81 
 
 		 355 aa  95.1  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  30 
 
 		 841 aa  93.6  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  28.03 
 
 		 384 aa  92.8  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.79 
 
 		 693 aa  92  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  37.91 
 
 		 418 aa  92  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  92  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  26.4 
 
 		 364 aa  91.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  27.02 
 
 		 343 aa  91.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  30.26 
 
 		 396 aa  90.9  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  34.98 
 
 		 899 aa  90.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1051 aa  90.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  29.26 
 
 		 315 aa  89.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  29.96 
 
 		 373 aa  89.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  29.2 
 
 		 404 aa  88.6  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  28.19 
 
 		 361 aa  87.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  25.97 
 
 		 719 aa  85.9  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 379 aa  84.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  28.5 
 
 		 684 aa  84  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  25.65 
 
 		 395 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3164  NHL repeat containing protein  29.66 
 
 		 297 aa  84  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  25.59 
 
 		 1763 aa  83.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  26.02 
 
 		 678 aa  83.2  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>