170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3475 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  100 
 
 
1140 aa  2273    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  51.01 
 
 
1146 aa  1008    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  49.39 
 
 
1163 aa  971    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  38.78 
 
 
1177 aa  706    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1036  membrane-bound mannosyltransferase-like protein  28.42 
 
 
757 aa  245  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  37.67 
 
 
346 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  34.5 
 
 
930 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  36.18 
 
 
522 aa  159  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  35.21 
 
 
668 aa  159  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  34.58 
 
 
831 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  35.05 
 
 
387 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  34.23 
 
 
579 aa  147  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  34.39 
 
 
676 aa  146  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0292  glycosyl transferase family protein  42.55 
 
 
832 aa  142  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.395446  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3866  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
848 aa  142  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000236131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0243  glycosyl transferase family protein  42.44 
 
 
838 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 
627 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  35.06 
 
 
1293 aa  135  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34 
 
 
343 aa  132  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  37 
 
 
752 aa  128  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  28.09 
 
 
588 aa  127  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  31.95 
 
 
709 aa  127  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  32.86 
 
 
491 aa  125  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  31.83 
 
 
390 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  30.9 
 
 
392 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  33.1 
 
 
930 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3474  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
830 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.337129  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0497  hypothetical protein  35.03 
 
 
550 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.551431  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  35.25 
 
 
391 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  35.11 
 
 
307 aa  114  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  32.1 
 
 
1030 aa  114  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0728  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 
560 aa  112  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.0000421548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  37.63 
 
 
347 aa  112  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1439  hypothetical protein  37.97 
 
 
540 aa  108  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1555  glycosyl transferase family 39  28.88 
 
 
608 aa  106  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  36.56 
 
 
343 aa  104  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.74 
 
 
693 aa  103  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0697  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
543 aa  102  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.203692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  33.18 
 
 
1030 aa  101  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  31.02 
 
 
353 aa  99  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 
372 aa  99  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 
373 aa  98.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  30.98 
 
 
1079 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  39.18 
 
 
439 aa  96.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  29.25 
 
 
360 aa  97.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  34.67 
 
 
368 aa  96.3  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.96 
 
 
1750 aa  95.5  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 
319 aa  94.7  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  26.37 
 
 
525 aa  94.7  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  30.35 
 
 
850 aa  92.8  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  35.61 
 
 
1026 aa  92  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  30.39 
 
 
359 aa  91.7  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  28.15 
 
 
700 aa  91.3  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  31.82 
 
 
418 aa  90.9  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  31.41 
 
 
786 aa  90.1  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  32.08 
 
 
365 aa  89.4  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  30.26 
 
 
355 aa  89.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  32.26 
 
 
2296 aa  89  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1594  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
515 aa  88.2  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 
354 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  35.15 
 
 
1351 aa  85.9  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  31.16 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  26.96 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 
732 aa  85.5  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  28.05 
 
 
322 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  34.98 
 
 
1051 aa  83.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  28.37 
 
 
436 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  27.27 
 
 
361 aa  82  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.47 
 
 
1292 aa  81.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  28.37 
 
 
363 aa  80.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  33.76 
 
 
1763 aa  80.1  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  30.41 
 
 
963 aa  79.7  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  27.42 
 
 
379 aa  79  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  29 
 
 
719 aa  78.2  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.7 
 
 
1130 aa  77.4  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  33.98 
 
 
892 aa  77  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  31.07 
 
 
903 aa  76.3  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  27.91 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  28.99 
 
 
646 aa  75.1  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  44.94 
 
 
315 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  33.12 
 
 
888 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  25.75 
 
 
384 aa  72.8  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  28.79 
 
 
359 aa  73.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  31.5 
 
 
898 aa  72  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  27.15 
 
 
321 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  28.05 
 
 
364 aa  70.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  32.11 
 
 
937 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  29.35 
 
 
323 aa  70.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  27.04 
 
 
326 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  29.76 
 
 
664 aa  69.7  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  29.9 
 
 
404 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1913  dolichyl-phosphate-mannose- proteinmannosyltransf erase  31.79 
 
 
653 aa  69.3  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.954673  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  30.7 
 
 
841 aa  69.3  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  26.15 
 
 
1834 aa  68.6  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  29.85 
 
 
711 aa  68.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  30.31 
 
 
447 aa  68.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  26.95 
 
 
770 aa  68.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  27.48 
 
 
1068 aa  67.4  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  31.52 
 
 
396 aa  67.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  28.99 
 
 
405 aa  66.6  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>