256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0370 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 841 aa  1589    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  38.81 
 
 		 678 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  37.68 
 
 		 635 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.81 
 
 		 386 aa  150  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  40.89 
 
 		 663 aa  148  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  39.61 
 
 		 661 aa  147  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  39.47 
 
 		 688 aa  147  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  37.29 
 
 		 673 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  39.2 
 
 		 627 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  38.82 
 
 		 976 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.62 
 
 		 624 aa  142  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  28.7 
 
 		 2296 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  42.8 
 
 		 1073 aa  140  8.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  41.01 
 
 		 554 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.94 
 
 		 871 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  41.51 
 
 		 1037 aa  138  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  39.41 
 
 		 998 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  34.82 
 
 		 714 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.07 
 
 		 847 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  36.91 
 
 		 609 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.1 
 
 		 885 aa  134  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.19 
 
 		 905 aa  134  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.14 
 
 		 656 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  43.2 
 
 		 635 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.41 
 
 		 1412 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.52 
 
 		 510 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  38.08 
 
 		 442 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.79 
 
 		 1130 aa  122  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  30.36 
 
 		 346 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1030 aa  121  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.23 
 
 		 769 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  34.58 
 
 		 831 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.68 
 
 		 684 aa  120  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1051 aa  120  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  36.9 
 
 		 682 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  30.72 
 
 		 439 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  29.97 
 
 		 1750 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  29.37 
 
 		 1351 aa  117  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  36.65 
 
 		 643 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  27.78 
 
 		 676 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.19 
 
 		 2884 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  30.62 
 
 		 1550 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.85 
 
 		 464 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  32.06 
 
 		 1452 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  30.3 
 
 		 1026 aa  112  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  33.09 
 
 		 387 aa  111  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  34.66 
 
 		 1192 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.76 
 
 		 448 aa  111  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  30.38 
 
 		 850 aa  111  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  33.7 
 
 		 646 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.87 
 
 		 1292 aa  110  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  31.85 
 
 		 1763 aa  109  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.38 
 
 		 600 aa  109  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  32.11 
 
 		 589 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  29.22 
 
 		 600 aa  108  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  31.17 
 
 		 963 aa  107  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  31.44 
 
 		 640 aa  107  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  30 
 
 		 522 aa  107  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  29.87 
 
 		 570 aa  107  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  35.81 
 
 		 637 aa  106  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  29.56 
 
 		 627 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  31.96 
 
 		 848 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  29.88 
 
 		 892 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  30.28 
 
 		 930 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  36.12 
 
 		 667 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  31.67 
 
 		 668 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  29.68 
 
 		 930 aa  102  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.93 
 
 		 860 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.97 
 
 		 706 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.25 
 
 		 600 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  28.54 
 
 		 962 aa  101  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  31.05 
 
 		 805 aa  101  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  35.97 
 
 		 688 aa  100  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.41 
 
 		 543 aa  100  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  29.08 
 
 		 1293 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.08 
 
 		 326 aa  99  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 		 807 aa  98.2  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  32.53 
 
 		 772 aa  98.2  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 		 719 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.08 
 
 		 619 aa  97.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.64 
 
 		 530 aa  96.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  32.18 
 
 		 1312 aa  95.1  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.43 
 
 		 693 aa  95.1  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  29.89 
 
 		 600 aa  94  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  29.82 
 
 		 538 aa  94  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  33.1 
 
 		 1045 aa  94  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  30.23 
 
 		 390 aa  92  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  51.75 
 
 		 3911 aa  91.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.04 
 
 		 343 aa  91.7  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  28.15 
 
 		 709 aa  89.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  33.48 
 
 		 732 aa  89  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30 
 
 		 649 aa  88.2  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  29.3 
 
 		 579 aa  87.8  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.95 
 
 		 342 aa  88.2  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.06 
 
 		 795 aa  87.8  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  25.89 
 
 		 2831 aa  87  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  24.05 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  40.87 
 
 		 1879 aa  85.1  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 		 863 aa  84.3  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  33 
 
 		 833 aa  83.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>