137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3838 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 360 aa  741    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  46.35 
 
 		 363 aa  335  7e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  46.63 
 
 		 361 aa  317  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  32.55 
 
 		 372 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  31.88 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  34.38 
 
 		 365 aa  169  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  31.01 
 
 		 359 aa  169  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  35.59 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  31.23 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  31.09 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  28.36 
 
 		 354 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  32.97 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  31.86 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  29.31 
 
 		 355 aa  149  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  31.99 
 
 		 676 aa  138  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  31.02 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  31.6 
 
 		 930 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  30.51 
 
 		 346 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  31.27 
 
 		 668 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  30.26 
 
 		 491 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  29.26 
 
 		 831 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  29.9 
 
 		 379 aa  123  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  30.85 
 
 		 418 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  30.32 
 
 		 579 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  27.36 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  32.12 
 
 		 522 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  26.77 
 
 		 319 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  30.86 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  24.42 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  25.47 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  27.14 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  28.53 
 
 		 412 aa  106  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  28.67 
 
 		 627 aa  103  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  31.06 
 
 		 588 aa  102  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  28 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.73 
 
 		 1293 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  29.54 
 
 		 752 aa  97.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  26.3 
 
 		 1146 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  27.3 
 
 		 1163 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  31.15 
 
 		 709 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1030 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  28.23 
 
 		 1140 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  25.74 
 
 		 700 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.54 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  25.72 
 
 		 903 aa  87.8  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  26.95 
 
 		 899 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  29.09 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 898 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  29.94 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  28.1 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  27.62 
 
 		 525 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  27.49 
 
 		 930 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  31.38 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.62 
 
 		 1292 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  27.34 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  25.45 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1177 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  24.91 
 
 		 786 aa  73.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1068 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  26.28 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  26.25 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  26.55 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.76 
 
 		 693 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  30.04 
 
 		 747 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  27.85 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  27.27 
 
 		 639 aa  66.6  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  27.33 
 
 		 963 aa  66.2  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  27.75 
 
 		 888 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  27.03 
 
 		 930 aa  65.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  26.37 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 		 683 aa  63.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  23.86 
 
 		 1079 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  26.16 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  27.87 
 
 		 906 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  26.15 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  34.15 
 
 		 684 aa  60.8  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  26.57 
 
 		 646 aa  59.7  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  24 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1750 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  27.87 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  26.03 
 
 		 913 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  27.67 
 
 		 1026 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  22.3 
 
 		 1834 aa  56.2  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.81 
 
 		 1130 aa  56.2  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 1230 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1115  hypothetical protein  28.26 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581052  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  21.59 
 
 		 1351 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  24.67 
 
 		 2296 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  39.19 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  30.91 
 
 		 664 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  24.03 
 
 		 674 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3066  NHL repeat-containing protein  22.43 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1988  hypothetical protein  26.06 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  25.86 
 
 		 652 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  26.24 
 
 		 521 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1591  NHL repeat containing protein  23.42 
 
 		 686 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.24269  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0241  tetratricopeptide repeat domain protein  34.91 
 
 		 668 aa  51.2  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113606  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.45 
 
 		 493 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4570  NHL repeat containing protein  32.35 
 
 		 353 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>