39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1555 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1555  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
608 aa  1234    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0697  glycosyl transferase family protein  54.81 
 
 
543 aa  414  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.203692 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0728  glycosyl transferase family protein  51.44 
 
 
560 aa  404  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.0000421548  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1439  hypothetical protein  46.56 
 
 
540 aa  331  2e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1594  glycosyl transferase family protein  45.71 
 
 
515 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0497  hypothetical protein  27.45 
 
 
550 aa  184  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.551431  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 
1146 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1036  membrane-bound mannosyltransferase-like protein  33.94 
 
 
757 aa  115  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  28.88 
 
 
1140 aa  110  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  33.66 
 
 
1163 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  32.5 
 
 
1177 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0292  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
832 aa  92  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.395446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3474  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
830 aa  88.2  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.337129  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0243  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
838 aa  88.2  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3866  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
848 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000236131  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0709  dolichyl-phosphate-mannose- proteinmannosyltransf erase  29.23 
 
 
623 aa  75.5  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3515  membrane-bound mannosyltransferase-like protein  28.27 
 
 
530 aa  74.3  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178809  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1913  dolichyl-phosphate-mannose- proteinmannosyltransf erase  28.36 
 
 
653 aa  73.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.954673  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0068  PurK operon protein / membrane-bound mannosyltransferase  29.63 
 
 
580 aa  72.4  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0587914  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
510 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
513 aa  62  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1552  dolichyl-phosphate-mannose- proteinmannosyltransf erase  28.68 
 
 
572 aa  57.4  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329636  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  26.29 
 
 
531 aa  56.2  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  30.07 
 
 
536 aa  53.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2242  hypothetical protein  29.28 
 
 
537 aa  50.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
528 aa  50.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1976  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
541 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.167644  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4199  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
601 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.458284  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  23.32 
 
 
557 aa  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3370  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
582 aa  47.8  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0479028  normal  0.0785337 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  26.57 
 
 
565 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0471  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.2 
 
 
583 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  24.81 
 
 
514 aa  44.7  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0287  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
515 aa  44.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  22.05 
 
 
512 aa  44.3  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3477  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
564 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0502  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
414 aa  43.9  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  29.81 
 
 
492 aa  43.9  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1093  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
692 aa  43.5  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>