232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3370 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3370  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
582 aa  1190    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0479028  normal  0.0785337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1321  glycosyl transferase family 39  45.54 
 
 
541 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0482  glycosyl transferase family 39  41.37 
 
 
554 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0488  hypothetical protein  40.46 
 
 
549 aa  388  1e-106  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  27.61 
 
 
527 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
553 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  30.21 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  31.43 
 
 
520 aa  121  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  29.18 
 
 
553 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  29.56 
 
 
575 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
514 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.6 
 
 
546 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  28.99 
 
 
514 aa  114  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  27.54 
 
 
516 aa  110  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  28.13 
 
 
528 aa  110  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  31.96 
 
 
605 aa  107  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  27.43 
 
 
519 aa  105  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  31.38 
 
 
606 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.18 
 
 
556 aa  102  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  26.56 
 
 
323 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  24.63 
 
 
512 aa  100  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  28.65 
 
 
515 aa  100  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  27.71 
 
 
525 aa  99  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
564 aa  99.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  27.43 
 
 
622 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  27.43 
 
 
622 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 
586 aa  95.9  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  26.07 
 
 
563 aa  94  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.83 
 
 
556 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 
547 aa  92.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
554 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  24.4 
 
 
541 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  26.93 
 
 
601 aa  92  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
558 aa  91.3  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  28.15 
 
 
466 aa  91.7  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  26.29 
 
 
601 aa  90.5  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
631 aa  90.5  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  27.62 
 
 
612 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.94 
 
 
601 aa  89.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
558 aa  88.6  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  27.47 
 
 
575 aa  88.6  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.08 
 
 
576 aa  87.4  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.08 
 
 
576 aa  87.4  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.08 
 
 
576 aa  87.4  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.08 
 
 
576 aa  87.4  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.08 
 
 
568 aa  87  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  24.68 
 
 
612 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.08 
 
 
552 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  27.25 
 
 
558 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.29 
 
 
601 aa  86.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.7 
 
 
568 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.7 
 
 
553 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.81 
 
 
555 aa  85.1  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
600 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  26.65 
 
 
578 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  24.2 
 
 
557 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.67 
 
 
553 aa  84.3  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
613 aa  84  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
522 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
584 aa  83.2  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  23.51 
 
 
559 aa  83.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
603 aa  83.2  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
558 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0725  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
609 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  28.36 
 
 
585 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.2 
 
 
550 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.2 
 
 
550 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  25.6 
 
 
561 aa  81.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12641  glycosyltransferase  24.42 
 
 
604 aa  81.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.547801  hitchhiker  0.00232598 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0797  glycosyl transferase family 39  25.15 
 
 
423 aa  79.7  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000309537  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.35 
 
 
554 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.35 
 
 
554 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.91 
 
 
550 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0689  hypothetical protein  32.44 
 
 
493 aa  79.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.2 
 
 
550 aa  79.3  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.27 
 
 
550 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.35 
 
 
554 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.91 
 
 
550 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  23.91 
 
 
550 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  23.91 
 
 
550 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.91 
 
 
550 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.11 
 
 
563 aa  78.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  26.11 
 
 
563 aa  78.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.53 
 
 
569 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  25.82 
 
 
580 aa  78.2  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  25.34 
 
 
609 aa  78.2  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
573 aa  77  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0471  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.38 
 
 
583 aa  75.5  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.22 
 
 
478 aa  75.5  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0672  hypothetical protein  32.63 
 
 
493 aa  75.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1778  hypothetical protein  23.38 
 
 
596 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0586  hypothetical protein  23.9 
 
 
613 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  20.38 
 
 
611 aa  75.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.22 
 
 
477 aa  75.5  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0453  glycosyl transferase family 39  25.16 
 
 
556 aa  74.7  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.42 
 
 
549 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
557 aa  74.7  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0276  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.16 
 
 
556 aa  74.7  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.55 
 
 
550 aa  74.7  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04058  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  25 
 
 
573 aa  74.7  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>