210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1321 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1321  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
541 aa  1097    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3370  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 
582 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0479028  normal  0.0785337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0482  glycosyl transferase family 39  44.65 
 
 
554 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0488  hypothetical protein  42.1 
 
 
549 aa  422  1e-117  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  32.33 
 
 
516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  31.21 
 
 
520 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  29.56 
 
 
514 aa  117  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  31.42 
 
 
528 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  30.31 
 
 
515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  31.45 
 
 
515 aa  115  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  29.68 
 
 
527 aa  113  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  29.57 
 
 
519 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  24.3 
 
 
512 aa  108  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  30.31 
 
 
525 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  28.06 
 
 
575 aa  90.5  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  30.56 
 
 
323 aa  90.5  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0033  sugar transferase, putative  26.96 
 
 
484 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0047  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
484 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.243952  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0047  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
484 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247457  hitchhiker  0.000148849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0050  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
484 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.127538 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0689  hypothetical protein  35.75 
 
 
493 aa  87.8  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
603 aa  88.2  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0672  hypothetical protein  35.23 
 
 
493 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  25.71 
 
 
622 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  25.71 
 
 
622 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  26.41 
 
 
612 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
564 aa  84.7  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  30.71 
 
 
606 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  25.31 
 
 
605 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.56 
 
 
556 aa  82.8  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  23.26 
 
 
554 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
553 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  25.05 
 
 
612 aa  80.9  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  26.32 
 
 
578 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
547 aa  78.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  25.28 
 
 
585 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3588  glycosyl transferase family 39  29.92 
 
 
530 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.196881  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2518  glycosyl transferase family 39  29.92 
 
 
530 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.69 
 
 
550 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  36.7 
 
 
553 aa  77  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25 
 
 
546 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.93 
 
 
550 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.12 
 
 
601 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  25.07 
 
 
541 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
600 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.73 
 
 
568 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  22.96 
 
 
611 aa  75.1  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0725  glycosyl transferase family protein  33.52 
 
 
609 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  36.36 
 
 
466 aa  74.7  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.73 
 
 
576 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.73 
 
 
553 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.73 
 
 
576 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.14 
 
 
563 aa  74.3  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.73 
 
 
576 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.73 
 
 
568 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.73 
 
 
576 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  24.14 
 
 
563 aa  74.3  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.45 
 
 
550 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 
476 aa  73.9  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.65 
 
 
550 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  27.65 
 
 
550 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.65 
 
 
550 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  27.65 
 
 
550 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.65 
 
 
550 aa  73.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.65 
 
 
601 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  25.37 
 
 
609 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  24.21 
 
 
535 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 
522 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  24.21 
 
 
535 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  27.6 
 
 
563 aa  72  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0287  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 
515 aa  72.4  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2183  family 39 glycosyl transferase  25.39 
 
 
536 aa  71.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84477  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1778  hypothetical protein  24.4 
 
 
596 aa  72  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.43 
 
 
556 aa  72  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  27.65 
 
 
534 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02790  hypothetical protein  33.92 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.37 
 
 
550 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.67 
 
 
478 aa  70.9  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
586 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
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NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.67 
 
 
477 aa  70.9  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  23.94 
 
 
601 aa  70.5  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.01 
 
 
553 aa  70.5  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  25.23 
 
 
601 aa  70.1  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2555  melittin resistance protein, putative  25.43 
 
 
537 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
558 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
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NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 
631 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  25 
 
 
565 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal 
 
 
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NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
557 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_13408  putative glycosyltransferase  25.82 
 
 
526 aa  69.3  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_04058  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  28.51 
 
 
573 aa  68.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 
558 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
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NC_008312  Tery_3477  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
564 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 
584 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008820  P9303_06171  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.98 
 
 
613 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0423817 
 
 
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NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  23.68 
 
 
561 aa  67.8  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513205 
 
 
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NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  24.71 
 
 
580 aa  68.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
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NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
557 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
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NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  22.26 
 
 
559 aa  67.8  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_1864  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
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