208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0453 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0276  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  100 
 
 		 556 aa  1099    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0453  glycosyl transferase family 39  100 
 
 		 556 aa  1099    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  55.1 
 
 		 563 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  55.1 
 
 		 563 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  32.08 
 
 		 611 aa  232  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  27.94 
 
 		 512 aa  211  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  33.76 
 
 		 516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  33.14 
 
 		 515 aa  171  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  29.69 
 
 		 528 aa  160  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  31.53 
 
 		 527 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  31.43 
 
 		 520 aa  155  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 514 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 553 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  28.9 
 
 		 514 aa  150  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  33.14 
 
 		 515 aa  150  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  31.41 
 
 		 605 aa  149  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 		 554 aa  147  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  30.86 
 
 		 519 aa  147  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  32.92 
 
 		 575 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 		 631 aa  143  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 		 547 aa  143  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  30.29 
 
 		 553 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  29.61 
 
 		 525 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 		 666 aa  136  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 		 564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  29.95 
 
 		 563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 557 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  28.22 
 
 		 622 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  28.22 
 
 		 622 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  27.7 
 
 		 606 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.08 
 
 		 554 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.08 
 
 		 554 aa  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.08 
 
 		 554 aa  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.03 
 
 		 556 aa  120  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  30.48 
 
 		 609 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  27.71 
 
 		 561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.26 
 
 		 550 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.35 
 
 		 553 aa  117  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 586 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.22 
 
 		 552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  29.32 
 
 		 541 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  26.76 
 
 		 323 aa  114  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.25 
 
 		 555 aa  114  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  29.62 
 
 		 559 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  28.53 
 
 		 612 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  28.48 
 
 		 575 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1888  glycosyl transferase family 39  28.41 
 
 		 552 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0174434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2917  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 580 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  27.5 
 
 		 612 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  27.83 
 
 		 556 aa  108  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.13 
 
 		 569 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2544  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 		 581 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.327974  normal  0.26724 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0797  glycosyl transferase family 39  27.75 
 
 		 423 aa  107  8e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000309537  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  28.29 
 
 		 556 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3917  glycosyl transferase family protein 39  28.63 
 
 		 580 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  27.01 
 
 		 578 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.42 
 
 		 548 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  27.93 
 
 		 535 aa  104  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  27.93 
 
 		 535 aa  104  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.45 
 
 		 568 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2553  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 580 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.65 
 
 		 548 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.45 
 
 		 553 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.1 
 
 		 548 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  26.35 
 
 		 585 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.1 
 
 		 548 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.45 
 
 		 576 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1533  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 584 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.030992  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1778  hypothetical protein  29.22 
 
 		 596 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.71 
 
 		 556 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2076  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 		 580 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.93 
 
 		 548 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.45 
 
 		 576 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.45 
 
 		 576 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.45 
 
 		 568 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.45 
 
 		 576 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.83 
 
 		 546 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0586  hypothetical protein  31.01 
 
 		 613 aa  101  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.16 
 
 		 549 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  26.95 
 
 		 601 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  29.12 
 
 		 601 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 		 584 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 573 aa  99.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.73 
 
 		 550 aa  99  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 		 613 aa  98.2  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0012  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 557 aa  97.8  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2825  glycosyl transferase family 39  26.62 
 
 		 581 aa  97.8  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  23.98 
 
 		 565 aa  97.4  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  21.97 
 
 		 534 aa  97.1  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.13 
 
 		 550 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.16 
 
 		 601 aa  96.3  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.88 
 
 		 601 aa  96.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12641  glycosyltransferase  28.61 
 
 		 604 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.547801  hitchhiker  0.00232598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  26.62 
 
 		 556 aa  95.9  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.01 
 
 		 550 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4522  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 568 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185613  normal  0.129654 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.13 
 
 		 550 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  26.13 
 
 		 550 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 		 603 aa  94.4  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  26.13 
 
 		 550 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>