223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_4019 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  56.68 
 
 		 550 aa  645    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  56.68 
 
 		 550 aa  645    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  56.86 
 
 		 550 aa  649    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  56.68 
 
 		 550 aa  647    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  56.68 
 
 		 550 aa  645    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  56.68 
 
 		 550 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  56.68 
 
 		 550 aa  645    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  76.63 
 
 		 552 aa  855    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  56.68 
 
 		 550 aa  645    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  100 
 
 		 550 aa  1100    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  57.4 
 
 		 550 aa  653    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  61.84 
 
 		 553 aa  689    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  58.23 
 
 		 548 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  58.05 
 
 		 548 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  58.05 
 
 		 548 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  56.24 
 
 		 554 aa  629  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  56.24 
 
 		 554 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  56.06 
 
 		 554 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  57.87 
 
 		 548 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  57.87 
 
 		 548 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  56.96 
 
 		 555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  55.18 
 
 		 556 aa  568  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  55.56 
 
 		 556 aa  551  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  42.57 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18330  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  43.34 
 
 		 549 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0521799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  41.44 
 
 		 546 aa  379  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1589  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  42.78 
 
 		 549 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  40.93 
 
 		 549 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  42.51 
 
 		 550 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  36.62 
 
 		 575 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  32.61 
 
 		 541 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  31.44 
 
 		 553 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  34.01 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  31.23 
 
 		 563 aa  159  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 		 584 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  33.91 
 
 		 535 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  33.91 
 
 		 535 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 		 564 aa  151  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 		 557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  32.65 
 
 		 323 aa  146  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 		 553 aa  146  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  33.53 
 
 		 527 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  29.51 
 
 		 585 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  31.9 
 
 		 580 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  29.23 
 
 		 578 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  30.6 
 
 		 575 aa  133  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 558 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  27.25 
 
 		 559 aa  130  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 586 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2555  melittin resistance protein, putative  28.17 
 
 		 537 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.53 
 
 		 601 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4300  glycosyl transferase family 39  32.61 
 
 		 551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 		 534 aa  128  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 		 558 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.07 
 
 		 568 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.07 
 
 		 553 aa  127  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  30.77 
 
 		 528 aa  126  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.07 
 
 		 576 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 		 558 aa  126  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.07 
 
 		 576 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.07 
 
 		 576 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.07 
 
 		 568 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.07 
 
 		 576 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 551 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 573 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 		 558 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  29.68 
 
 		 556 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 600 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  28.8 
 
 		 516 aa  121  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  30.46 
 
 		 537 aa  120  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  30.52 
 
 		 556 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  29.13 
 
 		 556 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  29.62 
 
 		 613 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  28.03 
 
 		 520 aa  115  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02790  hypothetical protein  28.27 
 
 		 468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  28.01 
 
 		 476 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  27.02 
 
 		 540 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  28.22 
 
 		 515 aa  114  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 558 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1881  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 558 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300143  hitchhiker  0.00000511252 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1857  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 558 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.894443  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0276  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.24 
 
 		 556 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0453  glycosyl transferase family 39  26.24 
 
 		 556 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2190  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 541 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.59 
 
 		 477 aa  107  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.59 
 
 		 478 aa  106  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  29.06 
 
 		 525 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  26.33 
 
 		 606 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3950  glycosyl transferase family 39  29.23 
 
 		 540 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131348 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0714  hypothetical protein  29.88 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 		 631 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  28.65 
 
 		 514 aa  104  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  27.51 
 
 		 515 aa  103  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  23.92 
 
 		 601 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  26.54 
 
 		 622 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  26.54 
 
 		 622 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4250  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 463 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00142595  unclonable  0.0000000186135 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 557 aa  97.4  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>