236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6130 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  100 
 
 		 541 aa  1055    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  58.49 
 
 		 535 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  58.49 
 
 		 535 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  58.37 
 
 		 561 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  38.2 
 
 		 586 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  34.73 
 
 		 564 aa  307  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  35.31 
 
 		 563 aa  300  4e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  37.48 
 
 		 573 aa  296  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  36.84 
 
 		 556 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  35.91 
 
 		 585 aa  294  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  36.46 
 
 		 578 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  37.03 
 
 		 556 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  35.38 
 
 		 575 aa  281  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  36.31 
 
 		 576 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  36.31 
 
 		 576 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  36.31 
 
 		 576 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  36.31 
 
 		 576 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  36.31 
 
 		 568 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 		 558 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  36.13 
 
 		 553 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  34.34 
 
 		 580 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  36.07 
 
 		 556 aa  274  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 558 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  35.94 
 
 		 568 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 		 600 aa  273  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 		 558 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 		 558 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  36.43 
 
 		 601 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4300  glycosyl transferase family 39  35.97 
 
 		 551 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03137  hypothetical protein  36.7 
 
 		 551 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  35.06 
 
 		 553 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 		 553 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 		 558 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1857  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 		 558 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.894443  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1881  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 		 558 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300143  hitchhiker  0.00000511252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 		 554 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  42.77 
 
 		 575 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  37.94 
 
 		 323 aa  206  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  31.93 
 
 		 559 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  39.34 
 
 		 537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 		 584 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 		 534 aa  170  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.94 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.94 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.94 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.55 
 
 		 555 aa  165  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  33.87 
 
 		 540 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.24 
 
 		 550 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.03 
 
 		 552 aa  160  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 		 613 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.52 
 
 		 550 aa  157  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.61 
 
 		 556 aa  156  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 		 522 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 		 557 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.07 
 
 		 569 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.38 
 
 		 550 aa  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  26.71 
 
 		 605 aa  152  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.91 
 
 		 550 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.71 
 
 		 548 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.71 
 
 		 548 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.71 
 
 		 548 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.91 
 
 		 550 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  30.91 
 
 		 550 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2190  glycosyl transferase family protein  40.37 
 
 		 541 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.1 
 
 		 550 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  30.91 
 
 		 550 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.71 
 
 		 548 aa  151  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.91 
 
 		 550 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.21 
 
 		 550 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.43 
 
 		 548 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.56 
 
 		 553 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  30.36 
 
 		 606 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.59 
 
 		 556 aa  146  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.76 
 
 		 546 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  29.82 
 
 		 516 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  28.1 
 
 		 622 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  28.1 
 
 		 622 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18330  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.63 
 
 		 549 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0521799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 557 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1864  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.36 
 
 		 479 aa  136  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1589  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.04 
 
 		 549 aa  136  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  31.15 
 
 		 612 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  26.38 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  31.97 
 
 		 612 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 		 666 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  27.79 
 
 		 611 aa  133  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  26.51 
 
 		 601 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02790  hypothetical protein  28.27 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  29.05 
 
 		 609 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 		 631 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2555  melittin resistance protein, putative  29.43 
 
 		 537 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0471  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.21 
 
 		 583 aa  131  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12641  glycosyltransferase  29.79 
 
 		 604 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.547801  hitchhiker  0.00232598 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  31.16 
 
 		 527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0714  hypothetical protein  28.53 
 
 		 464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157083 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.78 
 
 		 601 aa  127  6e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.15 
 
 		 477 aa  125  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.15 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  26.49 
 
 		 601 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>