225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5966 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  100 
 
 		 535 aa  1056    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  84.22 
 
 		 561 aa  855    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  100 
 
 		 535 aa  1056    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  58.49 
 
 		 541 aa  612  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 		 586 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  37.15 
 
 		 556 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  36.69 
 
 		 556 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  36.33 
 
 		 556 aa  280  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  34.15 
 
 		 563 aa  279  7e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 		 553 aa  279  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  35.33 
 
 		 573 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 564 aa  270  5.9999999999999995e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  35.58 
 
 		 580 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4300  glycosyl transferase family 39  37.02 
 
 		 551 aa  266  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  32.65 
 
 		 575 aa  261  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  33.83 
 
 		 585 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  34.69 
 
 		 578 aa  256  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  35.81 
 
 		 554 aa  256  8e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_003296  RS03137  hypothetical protein  35.85 
 
 		 551 aa  249  8e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  33.92 
 
 		 553 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  43.83 
 
 		 575 aa  243  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 558 aa  236  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 		 600 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  31.94 
 
 		 559 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 558 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 		 558 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  38.17 
 
 		 553 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  38.17 
 
 		 568 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  38.17 
 
 		 576 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  38.17 
 
 		 576 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  38.17 
 
 		 576 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  38.17 
 
 		 576 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  38.17 
 
 		 568 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  41.39 
 
 		 537 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  37.93 
 
 		 601 aa  204  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  36.01 
 
 		 558 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  38.73 
 
 		 323 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 584 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 		 558 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1857  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 		 558 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.894443  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1881  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 		 558 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300143  hitchhiker  0.00000511252 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 		 613 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.02 
 
 		 550 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.21 
 
 		 554 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.21 
 
 		 554 aa  162  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 		 522 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.21 
 
 		 554 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  33.55 
 
 		 540 aa  161  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.06 
 
 		 550 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.33 
 
 		 552 aa  160  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.43 
 
 		 556 aa  160  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  33.42 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.06 
 
 		 550 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.75 
 
 		 550 aa  158  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.75 
 
 		 550 aa  157  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.75 
 
 		 550 aa  156  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  30.75 
 
 		 550 aa  156  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.75 
 
 		 550 aa  156  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  30.75 
 
 		 550 aa  156  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.51 
 
 		 555 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.31 
 
 		 553 aa  154  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.73 
 
 		 550 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  32.54 
 
 		 605 aa  149  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 666 aa  148  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.09 
 
 		 569 aa  146  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 		 557 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.16 
 
 		 548 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.16 
 
 		 548 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.16 
 
 		 548 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2190  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 		 541 aa  143  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.16 
 
 		 548 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.96 
 
 		 548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  28.29 
 
 		 512 aa  140  7.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.97 
 
 		 546 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 557 aa  136  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0471  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.31 
 
 		 583 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  33.13 
 
 		 606 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2555  melittin resistance protein, putative  27.4 
 
 		 537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.94 
 
 		 556 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12641  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 604 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.547801  hitchhiker  0.00232598 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  27.06 
 
 		 609 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  31.55 
 
 		 525 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 631 aa  127  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 		 476 aa  127  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  27.76 
 
 		 601 aa  126  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  30.79 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1589  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.6 
 
 		 549 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18330  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.02 
 
 		 549 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0521799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1864  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.59 
 
 		 479 aa  123  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  24.91 
 
 		 622 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  28.74 
 
 		 612 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  24.91 
 
 		 622 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  30.15 
 
 		 601 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  30.84 
 
 		 527 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.03 
 
 		 601 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.52 
 
 		 549 aa  120  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.25 
 
 		 550 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  29.06 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  28.15 
 
 		 612 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  29.45 
 
 		 519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>