199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1864 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1864  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  100 
 
 		 479 aa  968    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  46.65 
 
 		 476 aa  388  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02790  hypothetical protein  45.45 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0714  hypothetical protein  43.3 
 
 		 464 aa  352  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157083 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3628  glycosyl transferase family protein  45.23 
 
 		 479 aa  342  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4250  glycosyl transferase family protein  42.08 
 
 		 463 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00142595  unclonable  0.0000000186135 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0672  hypothetical protein  42 
 
 		 493 aa  286  8e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0689  hypothetical protein  41.4 
 
 		 493 aa  285  9e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0287  glycosyl transferase family protein  37 
 
 		 515 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  39.42 
 
 		 477 aa  272  8.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  39.42 
 
 		 478 aa  272  9e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0033  sugar transferase, putative  35.13 
 
 		 484 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0050  glycosyl transferase family protein  35.13 
 
 		 484 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.127538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0047  glycosyl transferase family protein  35.13 
 
 		 484 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.243952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0047  glycosyl transferase family protein  35.13 
 
 		 484 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247457  hitchhiker  0.000148849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5537  hypothetical protein  40.52 
 
 		 478 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63700  hypothetical protein  38.69 
 
 		 478 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 553 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  31.83 
 
 		 575 aa  143  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  30.38 
 
 		 553 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 554 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  30.36 
 
 		 541 aa  136  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 		 522 aa  123  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 557 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 		 564 aa  121  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  27.71 
 
 		 563 aa  120  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  29.59 
 
 		 535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  29.01 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  29.59 
 
 		 535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  30.22 
 
 		 512 aa  117  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  27.4 
 
 		 561 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  27.69 
 
 		 540 aa  116  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.58 
 
 		 576 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.58 
 
 		 576 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.58 
 
 		 576 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.69 
 
 		 568 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.58 
 
 		 576 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.41 
 
 		 553 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.61 
 
 		 568 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 		 558 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 557 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  29.91 
 
 		 578 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 		 558 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 		 558 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 		 534 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.39 
 
 		 554 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  28.46 
 
 		 585 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.39 
 
 		 554 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.39 
 
 		 554 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  32.11 
 
 		 601 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  29.67 
 
 		 622 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  29.67 
 
 		 622 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  27.76 
 
 		 528 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  27.16 
 
 		 520 aa  107  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  29.43 
 
 		 519 aa  104  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 		 586 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  26.91 
 
 		 527 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03137  hypothetical protein  28.44 
 
 		 551 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4300  glycosyl transferase family 39  28.35 
 
 		 551 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  26.33 
 
 		 515 aa  101  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 600 aa  101  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.63 
 
 		 556 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1881  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 		 558 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300143  hitchhiker  0.00000511252 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  26.35 
 
 		 516 aa  98.6  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 		 558 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  26.14 
 
 		 534 aa  99  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1857  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 		 558 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.894443  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  28.4 
 
 		 556 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 		 573 aa  97.8  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  32.13 
 
 		 556 aa  97.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.77 
 
 		 552 aa  97.8  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.57 
 
 		 546 aa  97.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.32 
 
 		 553 aa  97.4  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  27.3 
 
 		 575 aa  97.1  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  27.52 
 
 		 556 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.33 
 
 		 550 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  26.33 
 
 		 550 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.33 
 
 		 550 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  24.94 
 
 		 580 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.33 
 
 		 550 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  26.33 
 
 		 550 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.33 
 
 		 550 aa  94.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.33 
 
 		 550 aa  94  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.85 
 
 		 569 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.05 
 
 		 550 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.33 
 
 		 550 aa  94  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.88 
 
 		 555 aa  93.6  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  26.4 
 
 		 611 aa  93.2  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  27.98 
 
 		 606 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.12 
 
 		 550 aa  92.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  28.53 
 
 		 515 aa  92.4  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  25.93 
 
 		 612 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 		 547 aa  91.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  25.38 
 
 		 514 aa  91.3  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 666 aa  91.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 613 aa  91.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  25.64 
 
 		 612 aa  90.5  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 		 514 aa  90.5  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1778  hypothetical protein  28.14 
 
 		 596 aa  89.7  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>