257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_18330 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1589  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  97.45 
 
 
549 aa  931    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  62.36 
 
 
569 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18330  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  100 
 
 
549 aa  1071    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0521799  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  64.65 
 
 
549 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  63.48 
 
 
550 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  41.65 
 
 
550 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  41.1 
 
 
550 aa  428  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  41.74 
 
 
554 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  41.1 
 
 
550 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  41.1 
 
 
550 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  41.74 
 
 
554 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  40.92 
 
 
550 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  40.92 
 
 
550 aa  424  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  41.62 
 
 
548 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  41.1 
 
 
550 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  40.92 
 
 
550 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  42.66 
 
 
554 aa  425  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  40.92 
 
 
550 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  44.51 
 
 
550 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  44.7 
 
 
552 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  40.67 
 
 
555 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  41.44 
 
 
548 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  41.44 
 
 
548 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  41.62 
 
 
548 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  41.62 
 
 
548 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  44.8 
 
 
556 aa  411  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  40.42 
 
 
553 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  44.94 
 
 
556 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  34.93 
 
 
546 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  37.01 
 
 
575 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  34.26 
 
 
553 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
553 aa  167  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  33.63 
 
 
541 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  30.76 
 
 
559 aa  163  9e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  29.94 
 
 
554 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  31.92 
 
 
535 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  31.92 
 
 
535 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  32.02 
 
 
563 aa  150  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  32.17 
 
 
561 aa  150  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
564 aa  149  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  32.49 
 
 
323 aa  146  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
586 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  33.44 
 
 
556 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  31.55 
 
 
575 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  30.85 
 
 
585 aa  140  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 
557 aa  140  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 
584 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  31.03 
 
 
578 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
558 aa  136  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  33.56 
 
 
556 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.72 
 
 
553 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
558 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.72 
 
 
576 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.72 
 
 
576 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.72 
 
 
576 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.72 
 
 
576 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.72 
 
 
568 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
522 aa  135  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.41 
 
 
568 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  33.78 
 
 
556 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.91 
 
 
601 aa  134  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
558 aa  134  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
600 aa  128  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  32.39 
 
 
580 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
558 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
573 aa  124  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  31.25 
 
 
528 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4300  glycosyl transferase family 39  32.35 
 
 
551 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  29.87 
 
 
527 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
514 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  31.18 
 
 
563 aa  120  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  31.18 
 
 
563 aa  120  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03137  hypothetical protein  31.31 
 
 
551 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445477  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
534 aa  118  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  26.05 
 
 
609 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 
558 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1881  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 
558 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300143  hitchhiker  0.00000511252 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1857  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 
558 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.894443  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.98 
 
 
478 aa  113  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0453  glycosyl transferase family 39  31.33 
 
 
556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363312 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.98 
 
 
477 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0276  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  31.33 
 
 
556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  32.01 
 
 
537 aa  113  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  25.37 
 
 
512 aa  111  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
557 aa  112  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  26.11 
 
 
611 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  25.82 
 
 
601 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  25.91 
 
 
601 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
476 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2190  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
541 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314824  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
631 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
613 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  28.39 
 
 
519 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2420  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.76 
 
 
695 aa  105  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0370858  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25 
 
 
601 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  29.03 
 
 
515 aa  103  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  28.45 
 
 
605 aa  103  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2555  melittin resistance protein, putative  28.38 
 
 
537 aa  103  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02790  hypothetical protein  25.97 
 
 
468 aa  103  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 
666 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>