228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5573 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  100 
 
 		 537 aa  1051    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  44.24 
 
 		 534 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2190  glycosyl transferase family protein  45.3 
 
 		 541 aa  324  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  37.9 
 
 		 540 aa  301  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  37.43 
 
 		 522 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  41.39 
 
 		 535 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  41.39 
 
 		 535 aa  209  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  37.06 
 
 		 561 aa  198  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  36.83 
 
 		 575 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  40.53 
 
 		 541 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  38.66 
 
 		 556 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  38.51 
 
 		 556 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  34.73 
 
 		 553 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  38.91 
 
 		 556 aa  178  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  33.72 
 
 		 553 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 586 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  34.57 
 
 		 575 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  33.53 
 
 		 564 aa  169  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  34.23 
 
 		 563 aa  169  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  35.26 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  33.64 
 
 		 585 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 		 558 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  33.65 
 
 		 578 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 		 558 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  36.25 
 
 		 558 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03137  hypothetical protein  37.22 
 
 		 551 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  33.08 
 
 		 559 aa  157  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.39 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  34.81 
 
 		 558 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.39 
 
 		 576 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.39 
 
 		 576 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 		 600 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.39 
 
 		 601 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.39 
 
 		 576 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.39 
 
 		 576 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.39 
 
 		 568 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.08 
 
 		 568 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  32.88 
 
 		 580 aa  153  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 573 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4300  glycosyl transferase family 39  34.63 
 
 		 551 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 		 557 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.81 
 
 		 550 aa  144  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.18 
 
 		 550 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.49 
 
 		 550 aa  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  32.19 
 
 		 323 aa  141  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.18 
 
 		 550 aa  140  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0471  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  36.75 
 
 		 583 aa  140  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.18 
 
 		 550 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  32.18 
 
 		 550 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  32.18 
 
 		 550 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.18 
 
 		 550 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.86 
 
 		 550 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 584 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.48 
 
 		 556 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1881  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 		 558 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300143  hitchhiker  0.00000511252 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 		 558 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1857  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 		 558 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.894443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.16 
 
 		 552 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 		 557 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.12 
 
 		 556 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.3 
 
 		 550 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.63 
 
 		 555 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.22 
 
 		 548 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.22 
 
 		 548 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.22 
 
 		 548 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.22 
 
 		 548 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.91 
 
 		 548 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.59 
 
 		 554 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.59 
 
 		 554 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.59 
 
 		 554 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.51 
 
 		 546 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  31.04 
 
 		 525 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.71 
 
 		 553 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 613 aa  118  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02790  hypothetical protein  29.45 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 631 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.34 
 
 		 569 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  27.35 
 
 		 622 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  27.35 
 
 		 622 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.15 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  27.62 
 
 		 515 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.15 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0672  hypothetical protein  30.77 
 
 		 493 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 		 476 aa  103  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  27.22 
 
 		 605 aa  103  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.17 
 
 		 550 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0287  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 		 515 aa  103  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.39 
 
 		 549 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  32.28 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0689  hypothetical protein  29.82 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  27.91 
 
 		 516 aa  101  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  26.7 
 
 		 612 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0033  sugar transferase, putative  28.62 
 
 		 484 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0047  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 		 484 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247457  hitchhiker  0.000148849 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  27.16 
 
 		 612 aa  98.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0050  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 		 484 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.127538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0047  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 		 484 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.243952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1589  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.03 
 
 		 549 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  29.54 
 
 		 527 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5537  hypothetical protein  32.64 
 
 		 478 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>