206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2758 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
534 aa  1089    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  43.69 
 
 
537 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  38.67 
 
 
540 aa  327  3e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2190  glycosyl transferase family protein  42.32 
 
 
541 aa  313  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314824  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 
522 aa  254  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
553 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  36.34 
 
 
553 aa  190  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  37.85 
 
 
575 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 
586 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  31.68 
 
 
575 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  35.5 
 
 
541 aa  170  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
584 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  36.48 
 
 
556 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  35.5 
 
 
556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  33.69 
 
 
559 aa  163  7e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
558 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 
564 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  34.65 
 
 
563 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  35.1 
 
 
556 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
558 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
558 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  33.42 
 
 
535 aa  160  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  33.42 
 
 
535 aa  160  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.6 
 
 
568 aa  160  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.6 
 
 
553 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.29 
 
 
576 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  37.2 
 
 
573 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.39 
 
 
601 aa  158  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.29 
 
 
576 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.29 
 
 
576 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.29 
 
 
576 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  34.29 
 
 
568 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
558 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  34.19 
 
 
578 aa  153  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  32.8 
 
 
585 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 
557 aa  151  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  34.25 
 
 
323 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  31.81 
 
 
580 aa  149  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  31.55 
 
 
561 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.2 
 
 
556 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
600 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4300  glycosyl transferase family 39  31.55 
 
 
551 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.62 
 
 
553 aa  143  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1881  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 
558 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300143  hitchhiker  0.00000511252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.41 
 
 
555 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 
558 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1857  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 
558 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.894443  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03137  hypothetical protein  32.89 
 
 
551 aa  140  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445477  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  28.87 
 
 
622 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  28.87 
 
 
622 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.89 
 
 
554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.89 
 
 
554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.89 
 
 
554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.18 
 
 
556 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.67 
 
 
552 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.04 
 
 
550 aa  126  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  30.7 
 
 
515 aa  124  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.09 
 
 
569 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.28 
 
 
549 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02790  hypothetical protein  29.34 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.8 
 
 
478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.8 
 
 
477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  27.61 
 
 
476 aa  121  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.27 
 
 
546 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  28.43 
 
 
606 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  28.25 
 
 
601 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  30.22 
 
 
528 aa  117  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.51 
 
 
550 aa  117  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  30.51 
 
 
550 aa  117  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.42 
 
 
550 aa  117  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  30.51 
 
 
550 aa  117  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  31.44 
 
 
516 aa  117  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.51 
 
 
550 aa  117  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.51 
 
 
550 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.51 
 
 
550 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.51 
 
 
550 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  32.28 
 
 
515 aa  114  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.21 
 
 
550 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  29.02 
 
 
520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  29.96 
 
 
514 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 
613 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  27.01 
 
 
612 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.69 
 
 
550 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  26.32 
 
 
527 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1864  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.49 
 
 
479 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
631 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  27.6 
 
 
601 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.21 
 
 
548 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0471  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.3 
 
 
583 aa  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.21 
 
 
548 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.21 
 
 
548 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.21 
 
 
548 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  26.54 
 
 
605 aa  107  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.88 
 
 
548 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
666 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.25 
 
 
601 aa  104  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0586  hypothetical protein  30.59 
 
 
613 aa  103  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  26.04 
 
 
612 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>