230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1767 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  77.29 
 
 
576 aa  848    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  78.12 
 
 
553 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1881  glycosyl transferase family protein  94.62 
 
 
558 aa  952    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300143  hitchhiker  0.00000511252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  93.01 
 
 
558 aa  988    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  76.58 
 
 
601 aa  850    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  73.43 
 
 
578 aa  836    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  94.62 
 
 
558 aa  952    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  72.22 
 
 
585 aa  840    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  98.39 
 
 
558 aa  1105    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1857  glycosyl transferase family protein  94.62 
 
 
558 aa  952    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.894443  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
558 aa  1118    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  69.39 
 
 
600 aa  809    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  77.29 
 
 
576 aa  848    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  77.29 
 
 
576 aa  848    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  77.29 
 
 
568 aa  848    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  77.29 
 
 
568 aa  848    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  77.29 
 
 
576 aa  848    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  92.47 
 
 
558 aa  1021    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  50.76 
 
 
556 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  48.71 
 
 
563 aa  502  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  47.83 
 
 
564 aa  502  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  50.19 
 
 
556 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  46.08 
 
 
586 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  48.83 
 
 
556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  45.6 
 
 
573 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  44.74 
 
 
580 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  43.12 
 
 
575 aa  418  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4300  glycosyl transferase family 39  37.73 
 
 
551 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03137  hypothetical protein  39.24 
 
 
551 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445477  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  34.97 
 
 
541 aa  289  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
553 aa  262  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
554 aa  259  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  43.15 
 
 
553 aa  249  9e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  31.71 
 
 
561 aa  239  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  31.35 
 
 
535 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  31.35 
 
 
535 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  41.49 
 
 
575 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  30.77 
 
 
559 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  38.78 
 
 
323 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 
584 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 
522 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  35.08 
 
 
540 aa  170  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 
534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  36.56 
 
 
537 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  32.47 
 
 
605 aa  157  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  27.85 
 
 
611 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
666 aa  153  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  31.62 
 
 
622 aa  153  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  31.62 
 
 
622 aa  153  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 
613 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  37.28 
 
 
606 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
557 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.31 
 
 
550 aa  145  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31 
 
 
550 aa  144  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.31 
 
 
550 aa  144  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.31 
 
 
550 aa  144  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  31.31 
 
 
550 aa  144  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.31 
 
 
550 aa  144  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  24.43 
 
 
512 aa  143  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  31.31 
 
 
550 aa  144  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.7 
 
 
546 aa  143  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.31 
 
 
550 aa  143  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31 
 
 
550 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.25 
 
 
553 aa  137  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.14 
 
 
555 aa  136  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  31.65 
 
 
515 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
631 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.06 
 
 
552 aa  135  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2190  glycosyl transferase family protein  36.79 
 
 
541 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314824  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.66 
 
 
548 aa  133  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 
557 aa  133  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.66 
 
 
548 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.66 
 
 
548 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.66 
 
 
548 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31 
 
 
556 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.66 
 
 
548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.19 
 
 
550 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  29.83 
 
 
612 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  30.42 
 
 
528 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  28.35 
 
 
516 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
476 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  29.34 
 
 
612 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  33.01 
 
 
527 aa  128  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.85 
 
 
554 aa  126  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.85 
 
 
554 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.85 
 
 
554 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.6 
 
 
556 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  29.41 
 
 
515 aa  124  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  31.07 
 
 
519 aa  123  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  27.86 
 
 
601 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18330  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.47 
 
 
549 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0521799  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  28.93 
 
 
520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1589  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.47 
 
 
549 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
514 aa  118  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.55 
 
 
601 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0471  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.8 
 
 
583 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  32.28 
 
 
478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  32.28 
 
 
477 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  28.11 
 
 
601 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0287  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>