244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1792 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
528 aa  1058    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  58.48 
 
 
514 aa  568  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  58.33 
 
 
520 aa  565  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  56.1 
 
 
515 aa  565  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  58.48 
 
 
516 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  55.29 
 
 
514 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  54.22 
 
 
515 aa  488  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  46.5 
 
 
527 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  41.49 
 
 
519 aa  390  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  43.1 
 
 
547 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  40 
 
 
525 aa  341  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 
603 aa  254  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  31.2 
 
 
605 aa  183  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  28.29 
 
 
512 aa  171  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
631 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  29.26 
 
 
612 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  29.22 
 
 
622 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  29.22 
 
 
622 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
666 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.11 
 
 
563 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  29.11 
 
 
563 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  28.46 
 
 
612 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
554 aa  159  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  34.47 
 
 
575 aa  157  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  34.17 
 
 
606 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
553 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 
557 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1778  hypothetical protein  34.63 
 
 
596 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0276  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.69 
 
 
556 aa  146  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0453  glycosyl transferase family 39  29.69 
 
 
556 aa  146  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  31.86 
 
 
553 aa  146  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.04 
 
 
601 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  29.87 
 
 
611 aa  143  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  31.27 
 
 
609 aa  143  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.29 
 
 
554 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.29 
 
 
554 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.29 
 
 
554 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06171  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  35.65 
 
 
613 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0423817 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  31.95 
 
 
601 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0488  hypothetical protein  30.54 
 
 
549 aa  137  7.000000000000001e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  33.01 
 
 
323 aa  136  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12641  glycosyltransferase  28.46 
 
 
604 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.547801  hitchhiker  0.00232598 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  30.47 
 
 
601 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.77 
 
 
556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0380  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 
570 aa  134  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.79 
 
 
553 aa  133  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.96 
 
 
555 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.53 
 
 
546 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  28.77 
 
 
534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.72 
 
 
601 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.54 
 
 
553 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.54 
 
 
568 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0586  hypothetical protein  31.85 
 
 
613 aa  127  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.41 
 
 
576 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.41 
 
 
568 aa  126  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.41 
 
 
576 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.41 
 
 
576 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.41 
 
 
576 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1888  glycosyl transferase family 39  29.89 
 
 
552 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0174434 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
564 aa  126  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  31.41 
 
 
541 aa  125  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2389  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
637 aa  124  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.81 
 
 
556 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.97 
 
 
552 aa  124  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
558 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  29.38 
 
 
563 aa  124  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 
558 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
558 aa  123  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
600 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
558 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.27 
 
 
550 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  28.43 
 
 
585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  29.07 
 
 
578 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.19 
 
 
550 aa  120  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  29.77 
 
 
561 aa  120  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  30.79 
 
 
535 aa  120  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  30.79 
 
 
535 aa  120  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
586 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
584 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.87 
 
 
550 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.63 
 
 
548 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
613 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.63 
 
 
548 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
534 aa  117  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.87 
 
 
550 aa  117  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.63 
 
 
548 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.63 
 
 
548 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  29.1 
 
 
580 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1321  glycosyl transferase family 39  31.42 
 
 
541 aa  116  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.55 
 
 
550 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  29.55 
 
 
550 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.55 
 
 
550 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.63 
 
 
548 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  29.55 
 
 
550 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.55 
 
 
550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  28.48 
 
 
559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0797  glycosyl transferase family 39  27.86 
 
 
423 aa  115  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000309537  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.22 
 
 
550 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
573 aa  114  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1881  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
558 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300143  hitchhiker  0.00000511252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>