214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1771 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  100 
 
 		 525 aa  1065    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  40 
 
 		 528 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  39.54 
 
 		 547 aa  326  6e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  38.94 
 
 		 514 aa  311  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  37.21 
 
 		 515 aa  310  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  38.09 
 
 		 520 aa  309  6.999999999999999e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 		 514 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  37.93 
 
 		 527 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  35.66 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  37.4 
 
 		 515 aa  269  8e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  32.73 
 
 		 519 aa  242  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 		 603 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  27.08 
 
 		 512 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  29.31 
 
 		 605 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 554 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0453  glycosyl transferase family 39  29.61 
 
 		 556 aa  128  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0276  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.61 
 
 		 556 aa  128  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  29.94 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  30.61 
 
 		 561 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2389  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 637 aa  124  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  24.53 
 
 		 611 aa  124  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  31.55 
 
 		 535 aa  124  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  31.55 
 
 		 535 aa  124  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  29.19 
 
 		 622 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  29.19 
 
 		 622 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  27.15 
 
 		 563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.15 
 
 		 563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 		 666 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  28.77 
 
 		 541 aa  120  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 557 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  31.96 
 
 		 575 aa  120  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  28.62 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  30 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0380  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12641  glycosyltransferase  22.69 
 
 		 604 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.547801  hitchhiker  0.00232598 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.19 
 
 		 601 aa  113  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  31.1 
 
 		 323 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  23.96 
 
 		 601 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  31.04 
 
 		 537 aa  111  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 		 553 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.69 
 
 		 546 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.18 
 
 		 554 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.18 
 
 		 554 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.18 
 
 		 554 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.88 
 
 		 552 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1321  glycosyl transferase family 39  27.62 
 
 		 541 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.41 
 
 		 555 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.98 
 
 		 553 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 631 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  24.35 
 
 		 612 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 		 586 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  25.2 
 
 		 612 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  23.61 
 
 		 601 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4522  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 		 568 aa  105  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185613  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02790  hypothetical protein  29.81 
 
 		 468 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4551  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 577 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.44 
 
 		 550 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0488  hypothetical protein  27.36 
 
 		 549 aa  101  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  24.81 
 
 		 609 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 534 aa  101  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1888  glycosyl transferase family 39  27.1 
 
 		 552 aa  100  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0174434 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.44 
 
 		 550 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.79 
 
 		 550 aa  100  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.03 
 
 		 548 aa  100  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.74 
 
 		 548 aa  100  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.74 
 
 		 548 aa  100  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.44 
 
 		 550 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  28.44 
 
 		 550 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.74 
 
 		 548 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1778  hypothetical protein  29.39 
 
 		 596 aa  99.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2917  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 580 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2544  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 		 581 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.327974  normal  0.26724 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.74 
 
 		 548 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.44 
 
 		 550 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  28.44 
 
 		 550 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.39 
 
 		 550 aa  99  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.44 
 
 		 550 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.12 
 
 		 550 aa  98.6  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2076  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 		 580 aa  97.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06171  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.64 
 
 		 613 aa  97.4  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0423817 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  27.12 
 
 		 540 aa  96.7  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  26.95 
 
 		 585 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  25.09 
 
 		 563 aa  96.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2825  glycosyl transferase family 39  28.21 
 
 		 581 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 		 564 aa  95.1  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0471  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.49 
 
 		 583 aa  94.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2553  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 580 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  26.05 
 
 		 575 aa  93.6  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0586  hypothetical protein  27.89 
 
 		 613 aa  93.2  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  26.87 
 
 		 578 aa  93.2  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1533  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 584 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.030992  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  27.33 
 
 		 534 aa  92.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.54 
 
 		 556 aa  91.3  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.04 
 
 		 556 aa  90.9  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1482  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 		 547 aa  90.9  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 		 584 aa  90.1  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0482  glycosyl transferase family 39  23.49 
 
 		 554 aa  90.1  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  27.78 
 
 		 556 aa  90.1  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_003296  RS03137  hypothetical protein  27.83 
 
 		 551 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>