209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0047 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0033  sugar transferase, putative  100 
 
 
484 aa  973    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0050  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
484 aa  973    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.127538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0047  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
484 aa  973    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.243952  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0047  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
484 aa  973    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247457  hitchhiker  0.000148849 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0287  glycosyl transferase family protein  40.21 
 
 
515 aa  318  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  39.53 
 
 
476 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02790  hypothetical protein  38.94 
 
 
468 aa  300  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0714  hypothetical protein  39.74 
 
 
464 aa  285  9e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0157083 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1864  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  35.13 
 
 
479 aa  283  6.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0689  hypothetical protein  35.82 
 
 
493 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3628  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 
479 aa  276  8e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0672  hypothetical protein  37.72 
 
 
493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5537  hypothetical protein  41.05 
 
 
478 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4250  glycosyl transferase family protein  39.48 
 
 
463 aa  251  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00142595  unclonable  0.0000000186135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63700  hypothetical protein  40 
 
 
478 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672224  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  38.93 
 
 
478 aa  237  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  38.93 
 
 
477 aa  237  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  33.33 
 
 
575 aa  176  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  32.19 
 
 
553 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 
554 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  32.62 
 
 
553 aa  156  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
522 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  31.37 
 
 
541 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
584 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  29.52 
 
 
323 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  26.65 
 
 
557 aa  124  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.22 
 
 
576 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.22 
 
 
576 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.22 
 
 
576 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.22 
 
 
576 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.22 
 
 
568 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.91 
 
 
553 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.91 
 
 
568 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  28.74 
 
 
535 aa  117  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  28.74 
 
 
535 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  26.28 
 
 
540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
558 aa  114  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
564 aa  114  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
600 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.15 
 
 
601 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  27.94 
 
 
561 aa  113  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
558 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
558 aa  113  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  29.14 
 
 
563 aa  113  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  27.55 
 
 
512 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
558 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  28.97 
 
 
578 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  28.97 
 
 
515 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  29.18 
 
 
585 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  29.12 
 
 
537 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  25.47 
 
 
520 aa  106  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  26.24 
 
 
575 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_003296  RS03137  hypothetical protein  29.84 
 
 
551 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445477  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0725  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
609 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  26.4 
 
 
527 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1321  glycosyl transferase family 39  29.83 
 
 
541 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  26.73 
 
 
559 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
557 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.93 
 
 
553 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  26.65 
 
 
573 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.47 
 
 
554 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.47 
 
 
554 aa  100  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.47 
 
 
554 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 
586 aa  100  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4300  glycosyl transferase family 39  28.48 
 
 
551 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
534 aa  98.2  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  27.9 
 
 
601 aa  97.8  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2555  melittin resistance protein, putative  27.62 
 
 
537 aa  97.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  27.07 
 
 
519 aa  97.1  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  28.67 
 
 
622 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.08 
 
 
555 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  28.67 
 
 
622 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
558 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1881  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
558 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300143  hitchhiker  0.00000511252 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1857  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
558 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.894443  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  27.24 
 
 
556 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.08 
 
 
569 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  25.86 
 
 
556 aa  93.6  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  24.6 
 
 
528 aa  93.6  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.18 
 
 
601 aa  93.6  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  25.73 
 
 
525 aa  93.6  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
514 aa  93.2  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
631 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  29.66 
 
 
516 aa  91.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  25.69 
 
 
605 aa  91.7  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  27.95 
 
 
556 aa  91.3  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  27.17 
 
 
609 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.35 
 
 
552 aa  90.5  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.1 
 
 
546 aa  90.5  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  27.25 
 
 
612 aa  90.5  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  23.51 
 
 
611 aa  90.1  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  25.14 
 
 
580 aa  90.1  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.33 
 
 
548 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.33 
 
 
548 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.33 
 
 
548 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.33 
 
 
548 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  27.15 
 
 
601 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
477 aa  89  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.33 
 
 
548 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>