222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0482 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0482  glycosyl transferase family 39  100 
 
 		 554 aa  1123    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1321  glycosyl transferase family 39  44.75 
 
 		 541 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3370  glycosyl transferase family protein  40.98 
 
 		 582 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0479028  normal  0.0785337 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0488  hypothetical protein  39.01 
 
 		 549 aa  363  4e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  32.53 
 
 		 527 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  30.95 
 
 		 528 aa  124  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  27.83 
 
 		 514 aa  120  9e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  30.35 
 
 		 520 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  29.19 
 
 		 515 aa  108  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 		 514 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  33.43 
 
 		 553 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 553 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 		 554 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  29.41 
 
 		 575 aa  99.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  27.92 
 
 		 519 aa  99.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  27.32 
 
 		 512 aa  99.4  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  26.82 
 
 		 516 aa  98.2  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  28.07 
 
 		 515 aa  97.4  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  27.58 
 
 		 525 aa  94.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 564 aa  92.8  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  27.54 
 
 		 563 aa  91.3  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  24.29 
 
 		 611 aa  90.1  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  26.35 
 
 		 323 aa  90.1  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.3 
 
 		 601 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  25.13 
 
 		 541 aa  84.7  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  25.86 
 
 		 622 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  25.86 
 
 		 622 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 		 603 aa  83.2  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  25.32 
 
 		 565 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.91 
 
 		 556 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 547 aa  82  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2389  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 		 637 aa  81.3  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 		 557 aa  80.9  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  26.9 
 
 		 606 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.6 
 
 		 553 aa  80.9  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 613 aa  80.5  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.77 
 
 		 568 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.77 
 
 		 553 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.77 
 
 		 576 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 		 558 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.77 
 
 		 576 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.77 
 
 		 576 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.77 
 
 		 568 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.77 
 
 		 576 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 		 586 aa  77.8  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.09 
 
 		 563 aa  77.8  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  23.39 
 
 		 561 aa  77.8  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  24.09 
 
 		 563 aa  77.8  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  24.39 
 
 		 605 aa  77.4  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 		 631 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0287  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 		 515 aa  75.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 		 600 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.6 
 
 		 552 aa  75.1  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  22.76 
 
 		 666 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  24.13 
 
 		 585 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4325  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 		 574 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  22.2 
 
 		 578 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  30 
 
 		 559 aa  74.7  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 		 558 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  24.84 
 
 		 556 aa  74.3  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  26.15 
 
 		 609 aa  74.3  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 		 558 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  25.06 
 
 		 540 aa  73.9  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0033  sugar transferase, putative  35.51 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0047  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.243952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0050  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.127538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0047  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247457  hitchhiker  0.000148849 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.5 
 
 		 550 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0689  hypothetical protein  25.37 
 
 		 493 aa  73.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0672  hypothetical protein  25.18 
 
 		 493 aa  73.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.21 
 
 		 550 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4690  hypothetical protein  27.06 
 
 		 574 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3882  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 574 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3975  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 574 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4085  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 574 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3121  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 539 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0725  glycosyl transferase family protein  36.15 
 
 		 609 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1778  hypothetical protein  24.65 
 
 		 596 aa  71.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  24.77 
 
 		 575 aa  71.6  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  24.28 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12641  glycosyltransferase  24.51 
 
 		 604 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.547801  hitchhiker  0.00232598 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 		 574 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  32.7 
 
 		 574 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  30.56 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  24.68 
 
 		 556 aa  70.5  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  25.57 
 
 		 556 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.51 
 
 		 556 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  22.92 
 
 		 550 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  22.92 
 
 		 550 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  22.92 
 
 		 550 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  22.92 
 
 		 550 aa  68.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  22.92 
 
 		 550 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  22.92 
 
 		 550 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  22.64 
 
 		 550 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  26.74 
 
 		 580 aa  68.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0282  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 		 582 aa  68.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0629741  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1926  hypothetical protein  33.13 
 
 		 565 aa  68.2  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5109  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  25.74 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0131214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>