217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4085 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



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Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4690  hypothetical protein  95.3 
 
 
574 aa  1071    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  91.46 
 
 
574 aa  1024    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4325  glycosyl transferase family protein  91.11 
 
 
574 aa  1036    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  91.46 
 
 
574 aa  1024    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3882  glycosyl transferase family protein  99.83 
 
 
574 aa  1160    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3975  glycosyl transferase family protein  99.13 
 
 
574 aa  1154    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4085  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
574 aa  1161    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0114  hypothetical protein  66.1 
 
 
587 aa  712    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.112922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0282  glycosyl transferase family protein  53.72 
 
 
582 aa  562  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0629741  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  44.08 
 
 
585 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00382  glycosyl transferase, family 39  43.22 
 
 
580 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03391  glycosyl transferase, family 39  42.41 
 
 
600 aa  442  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04058  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  39.23 
 
 
573 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3582  glycosyl transferase family 39  39.44 
 
 
573 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2850  glycosyl transferase family protein  34.56 
 
 
508 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.078924 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1862  glycosyl transferase family protein  38.76 
 
 
565 aa  295  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1926  hypothetical protein  38.58 
 
 
565 aa  294  3e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5588  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  35.11 
 
 
576 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04470  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  37.32 
 
 
575 aa  256  7e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2993  glycosyl transferase family 39  37.43 
 
 
567 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0364175 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5109  glycosyl transferase family protein  43.71 
 
 
509 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  28.17 
 
 
563 aa  108  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  27.95 
 
 
575 aa  104  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 
564 aa  99  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  28.99 
 
 
561 aa  97.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3109  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.48 
 
 
665 aa  94.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00576177 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3950  glycosyl transferase family 39  26.21 
 
 
540 aa  94  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131348 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  27.63 
 
 
585 aa  94  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
600 aa  94  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.84 
 
 
552 aa  94  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.06 
 
 
601 aa  93.6  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.06 
 
 
555 aa  92.8  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3689  glycosyl transferase family 39  24.93 
 
 
524 aa  91.3  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.73 
 
 
556 aa  91.3  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  28.66 
 
 
528 aa  90.9  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.23 
 
 
568 aa  90.9  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  27.04 
 
 
578 aa  90.5  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.23 
 
 
576 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.23 
 
 
553 aa  90.1  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  28.07 
 
 
553 aa  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.23 
 
 
576 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.23 
 
 
576 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.23 
 
 
568 aa  90.1  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.23 
 
 
576 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
586 aa  88.6  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 
554 aa  87.8  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 
553 aa  87.4  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  26.12 
 
 
565 aa  87  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.8 
 
 
554 aa  87.4  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.8 
 
 
554 aa  87.4  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  27.33 
 
 
575 aa  87.4  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.8 
 
 
554 aa  87.4  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  27.13 
 
 
516 aa  86.7  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  27.3 
 
 
323 aa  87  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.32 
 
 
550 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  28.22 
 
 
520 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  26.86 
 
 
541 aa  85.5  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
613 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1534  putative glycosyltransferase  28.17 
 
 
532 aa  84  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
558 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.92 
 
 
556 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
514 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  24.22 
 
 
601 aa  80.9  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  27.22 
 
 
535 aa  81.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  27.22 
 
 
535 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  23.6 
 
 
611 aa  80.9  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  23.39 
 
 
601 aa  81.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  29.41 
 
 
556 aa  80.5  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2420  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.28 
 
 
695 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0370858  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
558 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  28.49 
 
 
556 aa  80.1  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3865  glycosyl transferase family 39  24.28 
 
 
540 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
558 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2836  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 
509 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779768  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  25.8 
 
 
515 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.33 
 
 
601 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.05 
 
 
569 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
558 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  25.78 
 
 
540 aa  77.8  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.62 
 
 
550 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  29.08 
 
 
556 aa  77  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1881  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
558 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300143  hitchhiker  0.00000511252 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
558 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1857  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
558 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.894443  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  27.23 
 
 
580 aa  76.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  23.61 
 
 
534 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  24.42 
 
 
563 aa  76.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 
584 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1843  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
730 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.42 
 
 
563 aa  76.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.33 
 
 
553 aa  75.1  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
522 aa  74.7  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.59 
 
 
549 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal 
 
 
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NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  23.89 
 
 
559 aa  73.9  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  24.93 
 
 
622 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  23.5 
 
 
605 aa  73.2  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  23.77 
 
 
666 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
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NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  25.07 
 
 
609 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  24.93 
 
 
622 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 
557 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
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