48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0502 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0502  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
414 aa  838    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  24.79 
 
 
441 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.4 
 
 
447 aa  86.7  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  29.93 
 
 
658 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  28.5 
 
 
538 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
567 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 
968 aa  63.5  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  39.53 
 
 
586 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  27.38 
 
 
541 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0697  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
543 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.203692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  25.5 
 
 
508 aa  60.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  35.71 
 
 
553 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  35.35 
 
 
520 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  29.93 
 
 
539 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  38.14 
 
 
584 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  29.26 
 
 
528 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 
493 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
493 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
493 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  36.36 
 
 
547 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 
516 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
528 aa  54.7  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3252  glycosyl transferase family 39  34.85 
 
 
522 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2869  glycosyl transferase family 39  34.85 
 
 
522 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0447081  normal  0.0253035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  32.69 
 
 
573 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0728  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 
560 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.0000421548  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 
534 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1555  glycosyl transferase family 39  27.21 
 
 
608 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  29.06 
 
 
566 aa  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
579 aa  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 
525 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  24.27 
 
 
523 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.7 
 
 
864 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  40.26 
 
 
537 aa  48.9  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2206  hypothetical protein  28.98 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 
541 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  28.31 
 
 
462 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  30.47 
 
 
536 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  30.92 
 
 
563 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0961  conserved hypothetical protein  25.34 
 
 
372 aa  46.6  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  24.26 
 
 
487 aa  47  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2726  tetratricopeptide TPR_4  25.16 
 
 
687 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  34.29 
 
 
638 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  29.26 
 
 
522 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  25.37 
 
 
559 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  33.67 
 
 
507 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  29.13 
 
 
534 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  27.52 
 
 
565 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>