194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0293 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  49.7 
 
 		 1140 aa  962    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  83.75 
 
 		 1146 aa  1903    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 1163 aa  2334    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  40.78 
 
 		 1177 aa  782    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1036  membrane-bound mannosyltransferase-like protein  27 
 
 		 757 aa  211  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  37.5 
 
 		 346 aa  179  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  38.21 
 
 		 930 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  36.76 
 
 		 522 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  34.28 
 
 		 831 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  35.23 
 
 		 668 aa  161  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  35.43 
 
 		 579 aa  160  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  35.56 
 
 		 676 aa  159  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  35.28 
 
 		 387 aa  145  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  35.65 
 
 		 1293 aa  145  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  34.2 
 
 		 491 aa  143  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  35.28 
 
 		 930 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  39.35 
 
 		 343 aa  142  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  34.32 
 
 		 709 aa  142  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  32.18 
 
 		 752 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  30.84 
 
 		 627 aa  135  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  42.5 
 
 		 391 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  34.64 
 
 		 390 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3866  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 		 848 aa  129  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000236131  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  28.8 
 
 		 588 aa  129  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  27.66 
 
 		 307 aa  127  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0243  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 838 aa  126  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0292  glycosyl transferase family protein  40.57 
 
 		 832 aa  125  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.395446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0497  hypothetical protein  21.95 
 
 		 550 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.551431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  34.67 
 
 		 392 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  36.14 
 
 		 319 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  34.74 
 
 		 343 aa  111  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  34.02 
 
 		 2296 aa  109  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3474  glycosyl transferase family protein  38.62 
 
 		 830 aa  109  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.337129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1555  glycosyl transferase family 39  33.18 
 
 		 608 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  29.36 
 
 		 355 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0728  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 560 aa  105  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.0000421548  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  29.24 
 
 		 525 aa  105  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  36.45 
 
 		 1351 aa  103  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  34.2 
 
 		 347 aa  103  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  34.39 
 
 		 353 aa  103  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  35.44 
 
 		 1030 aa  102  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  37.62 
 
 		 1750 aa  101  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0697  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 		 543 aa  99.4  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.203692 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  34.21 
 
 		 365 aa  99.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  31.41 
 
 		 372 aa  98.2  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  32.6 
 
 		 700 aa  98.2  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1439  hypothetical protein  36.76 
 
 		 540 aa  97.4  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.46 
 
 		 693 aa  97.8  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  32.41 
 
 		 664 aa  97.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  31 
 
 		 850 aa  96.3  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  30.98 
 
 		 646 aa  95.9  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  30.82 
 
 		 1079 aa  95.9  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  33.08 
 
 		 373 aa  94.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  30.52 
 
 		 361 aa  94  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  32.16 
 
 		 439 aa  93.2  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  34.82 
 
 		 368 aa  93.6  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  29.04 
 
 		 1030 aa  92.8  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  28.48 
 
 		 786 aa  92.8  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  27.3 
 
 		 360 aa  92  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 354 aa  90.9  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  32.89 
 
 		 1763 aa  91.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  33.16 
 
 		 418 aa  90.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  31.31 
 
 		 355 aa  90.1  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  30.19 
 
 		 436 aa  90.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  28.79 
 
 		 903 aa  89  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  31.02 
 
 		 321 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  28.5 
 
 		 343 aa  87  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1594  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 515 aa  86.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3164  NHL repeat containing protein  28.71 
 
 		 297 aa  85.9  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.55 
 
 		 1292 aa  85.9  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  33.16 
 
 		 732 aa  85.5  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  32.32 
 
 		 1051 aa  85.1  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  35.98 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  37.26 
 
 		 963 aa  84.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  30.91 
 
 		 396 aa  84.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  28.33 
 
 		 395 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  32.64 
 
 		 326 aa  83.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  30.47 
 
 		 1046 aa  82.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  32.07 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3259  NHL repeat containing protein  28.06 
 
 		 297 aa  82.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1068 aa  81.6  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  27.23 
 
 		 384 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  28.29 
 
 		 323 aa  80.9  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  33.83 
 
 		 1026 aa  80.1  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  30.41 
 
 		 412 aa  79.7  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  33.73 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  31.46 
 
 		 405 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  26.21 
 
 		 386 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 379 aa  77.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  31.38 
 
 		 639 aa  75.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3066  NHL repeat-containing protein  27.39 
 
 		 297 aa  75.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  27.36 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 		 892 aa  75.1  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  30.09 
 
 		 404 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0068  PurK operon protein / membrane-bound mannosyltransferase  30.64 
 
 		 580 aa  73.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0587914  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  26.09 
 
 		 363 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  29.81 
 
 		 805 aa  73.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 		 719 aa  73.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30 
 
 		 1130 aa  73.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 		 772 aa  72  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>