37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0728 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0728  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
560 aa  1128    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.0000421548  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0697  glycosyl transferase family protein  51.42 
 
 
543 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.203692 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1439  hypothetical protein  51.03 
 
 
540 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1594  glycosyl transferase family protein  47.55 
 
 
515 aa  502  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1555  glycosyl transferase family 39  51.2 
 
 
608 aa  394  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0497  hypothetical protein  35.25 
 
 
550 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.551431  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1036  membrane-bound mannosyltransferase-like protein  36.36 
 
 
757 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  28.28 
 
 
1146 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  31.5 
 
 
1140 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  30.14 
 
 
1163 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1913  dolichyl-phosphate-mannose- proteinmannosyltransf erase  34.29 
 
 
653 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.954673  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3474  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 
830 aa  93.2  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.337129  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3866  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
848 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000236131  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0292  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 
832 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.395446  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0068  PurK operon protein / membrane-bound mannosyltransferase  34.13 
 
 
580 aa  90.9  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0587914  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0243  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
838 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700396 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3515  membrane-bound mannosyltransferase-like protein  32.53 
 
 
530 aa  84  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178809  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  26.84 
 
 
1177 aa  83.6  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0709  dolichyl-phosphate-mannose- proteinmannosyltransf erase  32.35 
 
 
623 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1552  dolichyl-phosphate-mannose- proteinmannosyltransf erase  30.43 
 
 
572 aa  63.5  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329636  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  30.54 
 
 
469 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
510 aa  56.2  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  22.44 
 
 
514 aa  56.2  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
513 aa  53.5  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  32.24 
 
 
531 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  31.58 
 
 
536 aa  51.6  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  29.47 
 
 
469 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1976  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
541 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.167644  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4199  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
601 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.458284  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3950  glycosyl transferase family 39  22.83 
 
 
540 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131348 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  26.73 
 
 
528 aa  47.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  28 
 
 
727 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
522 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3477  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
564 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  28.4 
 
 
575 aa  43.9  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0502  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 
414 aa  43.5  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0471  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.36 
 
 
583 aa  43.9  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>