76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2749 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  72.92 
 
 
618 aa  851    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  100 
 
 
727 aa  1449    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2827  membrane protein-like protein  28.39 
 
 
704 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  27.03 
 
 
726 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  36.18 
 
 
536 aa  101  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  25.99 
 
 
531 aa  100  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  43.09 
 
 
516 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  43.09 
 
 
516 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  43.09 
 
 
516 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  42.28 
 
 
516 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  43.09 
 
 
516 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  35.07 
 
 
531 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 
510 aa  90.9  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  26.02 
 
 
729 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 
513 aa  88.2  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  28.4 
 
 
658 aa  85.1  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0152  hypothetical protein  28.74 
 
 
592 aa  80.1  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
483 aa  72  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  26.55 
 
 
532 aa  71.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  40.19 
 
 
544 aa  70.5  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  28.08 
 
 
616 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  31 
 
 
526 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  36.23 
 
 
588 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  28.65 
 
 
507 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  25.73 
 
 
529 aa  68.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4131  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
677 aa  68.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00103927  unclonable  0.000000000820148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  27.27 
 
 
557 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  34.48 
 
 
534 aa  65.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1150  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
681 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.620757  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  26.11 
 
 
564 aa  64.3  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  27.75 
 
 
618 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0394  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
682 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.29536  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  31.58 
 
 
558 aa  59.7  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0410  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
825 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  32.06 
 
 
593 aa  58.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1037  hypothetical protein  30.77 
 
 
602 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  27.68 
 
 
569 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  27.67 
 
 
592 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1047  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
753 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.172621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  33.61 
 
 
492 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  27.67 
 
 
592 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  27.78 
 
 
605 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
553 aa  54.3  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  34.75 
 
 
479 aa  52.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2370  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  34.44 
 
 
491 aa  53.5  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2478  hypothetical protein  30.47 
 
 
1043 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  36.84 
 
 
533 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  36.84 
 
 
533 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  25.88 
 
 
563 aa  51.6  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1439  hypothetical protein  26.73 
 
 
610 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  34.07 
 
 
517 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  26.03 
 
 
575 aa  51.2  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  31.53 
 
 
526 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  34.19 
 
 
506 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25481  hypothetical protein  26.94 
 
 
509 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  24.05 
 
 
565 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  29.65 
 
 
506 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3737  hypothetical protein  30.91 
 
 
996 aa  48.9  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  31.58 
 
 
507 aa  48.5  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0849  glycosyltransferase  31.58 
 
 
717 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0226156 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  23.29 
 
 
557 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  23.29 
 
 
557 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  25.09 
 
 
538 aa  47.8  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0482  glycosyl transferase family 39  29.52 
 
 
554 aa  47.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4444  hypothetical protein  34.62 
 
 
526 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1784  hypothetical protein  29.6 
 
 
998 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78034  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0728  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
560 aa  47  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.0000421548  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  29.51 
 
 
528 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4896  hypothetical protein  39.13 
 
 
638 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303518  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3705  hypothetical protein  36.99 
 
 
508 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  31.54 
 
 
486 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  28.69 
 
 
528 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  30.56 
 
 
512 aa  44.7  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  28.04 
 
 
546 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26381  dolichyl-phosphate-mannose- proteinmannosyltransferase  35.82 
 
 
515 aa  44.3  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.412029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2542  hypothetical protein  33.87 
 
 
707 aa  44.3  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>