145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4135 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 368 aa  730    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  35.31 
 
 		 354 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  35.78 
 
 		 384 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  33.12 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  32.29 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  34.28 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  35.5 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  34.08 
 
 		 396 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  32.8 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  32.47 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  32.57 
 
 		 355 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  33.74 
 
 		 343 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  30.97 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  32.23 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 930 aa  146  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  31.36 
 
 		 436 aa  146  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  31.66 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  32.1 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  34.04 
 
 		 346 aa  142  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  32.39 
 
 		 355 aa  142  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  30.97 
 
 		 361 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  34.07 
 
 		 359 aa  139  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  37.83 
 
 		 319 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  34.01 
 
 		 491 aa  133  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  34.04 
 
 		 831 aa  132  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  31.76 
 
 		 668 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  33.1 
 
 		 676 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  32.38 
 
 		 579 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  33 
 
 		 522 aa  119  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  30.72 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.47 
 
 		 343 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  30.37 
 
 		 752 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  31.72 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  34.54 
 
 		 1293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  30.43 
 
 		 525 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  36.18 
 
 		 390 aa  102  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  27.87 
 
 		 627 aa  102  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  30.87 
 
 		 1030 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  33.77 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  31.8 
 
 		 588 aa  97.4  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  34.83 
 
 		 709 aa  97.4  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  34.82 
 
 		 1163 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  30.99 
 
 		 392 aa  93.6  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  31.55 
 
 		 1146 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  33.94 
 
 		 1140 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  35.76 
 
 		 930 aa  89.7  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  30.71 
 
 		 898 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  27.87 
 
 		 307 aa  87.4  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  29.06 
 
 		 899 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  28.95 
 
 		 639 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  28.71 
 
 		 1068 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  28.9 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  35.06 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  30.49 
 
 		 888 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  41.28 
 
 		 683 aa  80.1  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  28.34 
 
 		 1177 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  26.52 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  27.71 
 
 		 700 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  27.54 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  27.66 
 
 		 903 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  33.78 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  26.18 
 
 		 963 aa  73.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  24.18 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  32.34 
 
 		 321 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  28.32 
 
 		 937 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  28.68 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  24.74 
 
 		 906 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  35.66 
 
 		 930 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  27.08 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  25.93 
 
 		 786 aa  67  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 1230 aa  67  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  30.48 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  39.06 
 
 		 684 aa  66.2  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.62 
 
 		 1292 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  29.02 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  31.94 
 
 		 711 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1026 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  25.8 
 
 		 1750 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  24.68 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  28.95 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25.18 
 
 		 913 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  32.26 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  29.25 
 
 		 2296 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  26.13 
 
 		 747 aa  60.1  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1351 aa  60.1  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.45 
 
 		 693 aa  60.1  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  26.56 
 
 		 1079 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0086  NHL repeat-containing protein  33.9 
 
 		 680 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1030 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1051 aa  56.6  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0177  NHL repeat containing protein  26.45 
 
 		 716 aa  56.2  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  27.97 
 
 		 664 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  23.75 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  26.27 
 
 		 805 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  25.84 
 
 		 646 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.47 
 
 		 1130 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3164  NHL repeat containing protein  32.14 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  23.9 
 
 		 2831 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  22.86 
 
 		 892 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>