135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1836 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 906 aa  1747    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  49.51 
 
 		 913 aa  757    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  41.65 
 
 		 888 aa  611  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  43.25 
 
 		 898 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  40.52 
 
 		 899 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  38.84 
 
 		 937 aa  489  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  39.7 
 
 		 405 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  37.86 
 
 		 404 aa  263  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  35.11 
 
 		 1951 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1804 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  37.34 
 
 		 916 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  31.69 
 
 		 930 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  32.37 
 
 		 2528 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  34.04 
 
 		 3586 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  31.38 
 
 		 549 aa  109  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  32.26 
 
 		 831 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  35.56 
 
 		 777 aa  108  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  28.98 
 
 		 676 aa  108  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  29.18 
 
 		 579 aa  104  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  31.7 
 
 		 2042 aa  103  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  30.28 
 
 		 346 aa  101  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  32.22 
 
 		 668 aa  100  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  32.05 
 
 		 365 aa  95.5  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  29.41 
 
 		 709 aa  94.4  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  26.78 
 
 		 343 aa  87.8  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  29.92 
 
 		 491 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  27.78 
 
 		 372 aa  84  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  27.43 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  32.24 
 
 		 752 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  27.09 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  30.1 
 
 		 627 aa  77.4  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  26.35 
 
 		 391 aa  77.4  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.14 
 
 		 343 aa  77  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  29.74 
 
 		 355 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  26.55 
 
 		 390 aa  76.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  30.62 
 
 		 1293 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  27.57 
 
 		 2625 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  25.1 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  28.23 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  25.13 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  32.37 
 
 		 694 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  51.43 
 
 		 1241 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  26.48 
 
 		 588 aa  72.8  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  31.13 
 
 		 2192 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  25.25 
 
 		 525 aa  72  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  29.24 
 
 		 347 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  28.73 
 
 		 2704 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  28.67 
 
 		 930 aa  70.1  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  32.55 
 
 		 6109 aa  69.3  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  24.74 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  30.84 
 
 		 1222 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  31.75 
 
 		 2117 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  27.9 
 
 		 2456 aa  67.8  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  29.24 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  29.41 
 
 		 387 aa  67.4  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  27.83 
 
 		 639 aa  65.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  28.14 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  31.94 
 
 		 696 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  25.07 
 
 		 1332 aa  63.9  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  25.82 
 
 		 307 aa  64.3  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  31.61 
 
 		 392 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  28.22 
 
 		 319 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  28.3 
 
 		 4689 aa  62.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  30.71 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  27.14 
 
 		 3739 aa  62.4  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  27.87 
 
 		 360 aa  62  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  40.21 
 
 		 1439 aa  61.6  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  26.64 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  24.39 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  26.78 
 
 		 6310 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  27.14 
 
 		 3824 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  26.85 
 
 		 396 aa  60.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  25.93 
 
 		 8064 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  27.14 
 
 		 3721 aa  60.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  28.43 
 
 		 3824 aa  59.7  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  28.67 
 
 		 3824 aa  58.9  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  24.37 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  28.5 
 
 		 1140 aa  58.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  47.54 
 
 		 983 aa  58.5  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  25 
 
 		 1030 aa  58.2  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  25.71 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  28.84 
 
 		 1047 aa  57.8  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  30.65 
 
 		 318 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  28.12 
 
 		 3325 aa  57.4  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  27.18 
 
 		 1424 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  26.04 
 
 		 3925 aa  57.4  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  32.14 
 
 		 1146 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  27.05 
 
 		 384 aa  56.2  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1474  hypothetical protein  34.88 
 
 		 383 aa  56.2  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  35.24 
 
 		 903 aa  55.8  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.31 
 
 		 1919 aa  55.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  25.87 
 
 		 2350 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  30.43 
 
 		 1962 aa  54.7  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  28.19 
 
 		 684 aa  53.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  25.34 
 
 		 321 aa  53.5  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1163 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  26.24 
 
 		 322 aa  52.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  26.85 
 
 		 3562 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.21 
 
 		 1750 aa  52.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.56 
 
 		 1726 aa  52  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>