52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2452 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 696 aa  1412    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  71.12 
 
 		 1219 aa  732    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  44.03 
 
 		 694 aa  502  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  36.38 
 
 		 1096 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  35.45 
 
 		 827 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  33.03 
 
 		 1804 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  35.29 
 
 		 899 aa  95.5  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  35.35 
 
 		 2042 aa  94.7  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  32.13 
 
 		 888 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  30.2 
 
 		 898 aa  82  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 937 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  28.1 
 
 		 1224 aa  80.1  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  30.45 
 
 		 2192 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  31.19 
 
 		 1902 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  30.54 
 
 		 913 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  31.94 
 
 		 906 aa  63.9  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  32.05 
 
 		 2528 aa  60.8  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  32.43 
 
 		 3586 aa  58.5  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.21 
 
 		 1919 aa  58.5  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  40.54 
 
 		 1241 aa  57.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  31.13 
 
 		 3325 aa  56.6  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0679  hypothetical protein  24.64 
 
 		 504 aa  56.2  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  28.71 
 
 		 1141 aa  56.2  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  28.37 
 
 		 1887 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  30.28 
 
 		 675 aa  54.7  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  32.84 
 
 		 549 aa  54.3  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  30.54 
 
 		 1461 aa  53.9  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  31.96 
 
 		 777 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  30.85 
 
 		 1951 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  27.03 
 
 		 1221 aa  50.8  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2331  hypothetical protein  33.01 
 
 		 316 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000168007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  29.28 
 
 		 1047 aa  49.3  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.05 
 
 		 1726 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  30.29 
 
 		 1222 aa  49.3  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0784  hypothetical protein  28.49 
 
 		 190 aa  48.5  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  37.14 
 
 		 983 aa  47.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1278 aa  47.8  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.48 
 
 		 729 aa  47.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  33.04 
 
 		 3822 aa  47.4  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  32.17 
 
 		 3861 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1474  hypothetical protein  31.53 
 
 		 383 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  32.28 
 
 		 1067 aa  46.6  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  27.92 
 
 		 1238 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2709  BNR domain-containing protein  23.03 
 
 		 1554 aa  45.8  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  29.54 
 
 		 916 aa  45.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  27.88 
 
 		 831 aa  44.7  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  29.38 
 
 		 482 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3967  fibronectin, type III domain-containing protein  40 
 
 		 486 aa  44.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.476574  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  34.16 
 
 		 3314 aa  44.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  34.15 
 
 		 4874 aa  44.3  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0137  hypothetical protein  35.56 
 
 		 304 aa  44.3  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0482876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  28.16 
 
 		 1332 aa  43.9  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>