118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3066 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  100 
 
 		 3925 aa  7759    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  32.03 
 
 		 3586 aa  173  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  25.78 
 
 		 1951 aa  143  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  28.27 
 
 		 898 aa  123  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  25.46 
 
 		 3562 aa  123  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  26.54 
 
 		 2456 aa  118  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  31.49 
 
 		 6109 aa  117  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  23.28 
 
 		 2552 aa  116  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4062  hypothetical protein  33.45 
 
 		 711 aa  109  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  33.85 
 
 		 2042 aa  102  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  28.65 
 
 		 4761 aa  100  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  29.35 
 
 		 913 aa  94  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  30.02 
 
 		 899 aa  93.2  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  26.05 
 
 		 2625 aa  86.7  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  33.01 
 
 		 549 aa  81.3  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  27.69 
 
 		 2528 aa  80.5  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  24.97 
 
 		 5561 aa  79  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  24.73 
 
 		 5561 aa  78.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  24.97 
 
 		 5561 aa  79  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1804 aa  77  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  25 
 
 		 5559 aa  77  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  28.68 
 
 		 777 aa  76.6  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  28.31 
 
 		 4689 aa  75.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  24.83 
 
 		 5559 aa  75.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  30.18 
 
 		 888 aa  72.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  29.01 
 
 		 352 aa  73.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1762 aa  73.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  31.36 
 
 		 2117 aa  72.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  24.48 
 
 		 2927 aa  72  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  32.31 
 
 		 2350 aa  70.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.78 
 
 		 5216 aa  69.3  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  26.24 
 
 		 5743 aa  69.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  27.82 
 
 		 937 aa  68.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  27.6 
 
 		 3739 aa  67  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  27.84 
 
 		 916 aa  67  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  28.97 
 
 		 1219 aa  67  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  26.64 
 
 		 5451 aa  66.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.03 
 
 		 4106 aa  65.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  21.86 
 
 		 1570 aa  65.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  27.6 
 
 		 3824 aa  64.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.93 
 
 		 3552 aa  63.9  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1902 aa  64.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  32.82 
 
 		 1222 aa  64.3  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  31.33 
 
 		 651 aa  63.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  27.22 
 
 		 3325 aa  63.9  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  22.25 
 
 		 1332 aa  63.5  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  36.03 
 
 		 536 aa  63.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  42.22 
 
 		 720 aa  62  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  35.57 
 
 		 693 aa  62.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  27.6 
 
 		 3824 aa  62  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  30.23 
 
 		 656 aa  61.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.82 
 
 		 1686 aa  61.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  27.6 
 
 		 3721 aa  61.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  27.27 
 
 		 3824 aa  60.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  29.45 
 
 		 635 aa  60.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  25.68 
 
 		 3923 aa  60.1  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  29.77 
 
 		 1026 aa  60.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  33.58 
 
 		 635 aa  60.1  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  20.93 
 
 		 1570 aa  59.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  26.48 
 
 		 1962 aa  59.3  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.11 
 
 		 1919 aa  59.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.72 
 
 		 1590 aa  59.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  31.53 
 
 		 2704 aa  58.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  30.38 
 
 		 739 aa  57.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  25.44 
 
 		 4874 aa  57.8  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  30.11 
 
 		 2178 aa  57.4  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  26.03 
 
 		 6310 aa  55.5  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2793  hypothetical protein  37.08 
 
 		 574 aa  55.5  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.430464  hitchhiker  0.000384805 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  38.68 
 
 		 685 aa  55.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  27.88 
 
 		 595 aa  55.5  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  33.58 
 
 		 978 aa  55.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  26.11 
 
 		 8064 aa  55.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  37.4 
 
 		 767 aa  55.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  34.12 
 
 		 1585 aa  55.5  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.86 
 
 		 995 aa  55.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  31.65 
 
 		 1621 aa  55.1  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  32.5 
 
 		 1577 aa  54.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1551  hypothetical protein  42.17 
 
 		 872 aa  53.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.966824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  30.28 
 
 		 499 aa  53.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1068  hypothetical protein  35.29 
 
 		 500 aa  53.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  31.22 
 
 		 1588 aa  53.5  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  25.73 
 
 		 906 aa  52.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  28.71 
 
 		 852 aa  53.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  24.34 
 
 		 5080 aa  53.1  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  40.66 
 
 		 439 aa  52.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  35.54 
 
 		 1792 aa  52.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  34.33 
 
 		 2796 aa  52.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  31.77 
 
 		 2002 aa  51.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  34.71 
 
 		 14944 aa  52  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  25.8 
 
 		 1461 aa  51.2  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  27.95 
 
 		 692 aa  50.8  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  26.69 
 
 		 1047 aa  50.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.38 
 
 		 1669 aa  50.8  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  37.5 
 
 		 3314 aa  50.1  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  38.74 
 
 		 1785 aa  50.1  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  34.25 
 
 		 577 aa  50.1  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  34.51 
 
 		 4379 aa  49.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1657 aa  50.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  27.14 
 
 		 675 aa  50.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1627 aa  49.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>