130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3412 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  34.16 
 
 		 6310 aa  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  37.68 
 
 		 4106 aa  804    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  87.51 
 
 		 2456 aa  3980    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  38.03 
 
 		 3562 aa  729    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  34.2 
 
 		 3739 aa  695    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  33.79 
 
 		 8064 aa  677    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  100 
 
 		 2625 aa  4841    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  33.14 
 
 		 3824 aa  698    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  44.42 
 
 		 2704 aa  993    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  34.22 
 
 		 5451 aa  691    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  31.36 
 
 		 3923 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  34.1 
 
 		 3721 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  34.51 
 
 		 3824 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  33.14 
 
 		 3824 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.55 
 
 		 3552 aa  615  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  31.7 
 
 		 3325 aa  515  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  30.88 
 
 		 4430 aa  382  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  33.88 
 
 		 3314 aa  380  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  31.44 
 
 		 3204 aa  341  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  33.43 
 
 		 2927 aa  329  5e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  30.37 
 
 		 2911 aa  291  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  26.61 
 
 		 5080 aa  291  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  28 
 
 		 7149 aa  283  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  30.71 
 
 		 6715 aa  268  8e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  26.59 
 
 		 5561 aa  256  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  26.63 
 
 		 5561 aa  255  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  26.62 
 
 		 5559 aa  253  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  26.62 
 
 		 5559 aa  253  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  27.04 
 
 		 5561 aa  251  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.94 
 
 		 6683 aa  224  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  26.78 
 
 		 6779 aa  211  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  26.67 
 
 		 6662 aa  209  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  30.4 
 
 		 4689 aa  204  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  28.73 
 
 		 4672 aa  133  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  28.24 
 
 		 16322 aa  132  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  26.58 
 
 		 4480 aa  130  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  36.07 
 
 		 1278 aa  123  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  30.56 
 
 		 1461 aa  122  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  29.15 
 
 		 3586 aa  116  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  35.01 
 
 		 2839 aa  114  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  28.05 
 
 		 4874 aa  113  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1448  hypothetical protein  31.07 
 
 		 1019 aa  108  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  28.26 
 
 		 4791 aa  107  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  29.75 
 
 		 500 aa  102  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  20.76 
 
 		 9867 aa  101  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  27.86 
 
 		 4678 aa  100  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  28.83 
 
 		 3516 aa  99  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3383  conserved repeat domain protein  32.2 
 
 		 888 aa  95.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0756  cobaltochelatase subunit CobN  25.33 
 
 		 2168 aa  92.8  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  30.68 
 
 		 899 aa  85.5  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  29.32 
 
 		 898 aa  85.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  26.65 
 
 		 8918 aa  84  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  26.54 
 
 		 3925 aa  81.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  28.38 
 
 		 2768 aa  78.2  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  27.56 
 
 		 1951 aa  77.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.82 
 
 		 11716 aa  76.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 		 5098 aa  73.6  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  28.54 
 
 		 4214 aa  70.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  39.43 
 
 		 747 aa  70.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.11 
 
 		 5216 aa  70.1  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  28.31 
 
 		 850 aa  70.1  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  26.93 
 
 		 2795 aa  69.7  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  28.03 
 
 		 913 aa  69.7  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  32.55 
 
 		 606 aa  69.3  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  39.31 
 
 		 635 aa  68.6  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1665  outer membrane adhesin like proteiin  33.73 
 
 		 2825 aa  67.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1665 aa  67.8  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.24 
 
 		 1586 aa  67  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  28.21 
 
 		 1787 aa  65.9  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.52 
 
 		 3038 aa  65.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  29.9 
 
 		 2402 aa  64.3  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  39.72 
 
 		 1538 aa  64.3  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  31.07 
 
 		 959 aa  63.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  31.47 
 
 		 5899 aa  63.2  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  24.67 
 
 		 2110 aa  62.8  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2918  hypothetical protein  35.5 
 
 		 714 aa  62.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  28.33 
 
 		 906 aa  61.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  28.28 
 
 		 2117 aa  60.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  29.61 
 
 		 888 aa  60.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  35.5 
 
 		 1597 aa  60.1  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.47 
 
 		 5839 aa  60.1  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.23 
 
 		 800 aa  60.1  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  33.4 
 
 		 1152 aa  60.1  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  27.6 
 
 		 1219 aa  60.1  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33215  hypothetical serine rich protein  25.21 
 
 		 2156 aa  59.7  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.963879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  26.58 
 
 		 3736 aa  59.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.66 
 
 		 1884 aa  58.9  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1112  peptidoglycan-binding LysM  26.85 
 
 		 322 aa  58.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  34.38 
 
 		 1869 aa  59.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  32.93 
 
 		 747 aa  59.3  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4062  hypothetical protein  28.44 
 
 		 711 aa  58.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4418  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1207 aa  58.2  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.535259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  26.87 
 
 		 1699 aa  57  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  28.12 
 
 		 3066 aa  56.6  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3082  peptidase domain protein  31 
 
 		 539 aa  56.6  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  34.32 
 
 		 824 aa  56.6  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  40.16 
 
 		 4748 aa  56.2  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  29.9 
 
 		 2552 aa  55.5  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  26.62 
 
 		 5442 aa  55.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2688  peptidoglycan-binding LysM  33.9 
 
 		 361 aa  55.5  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00047104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>