103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0987 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  46.43 
 
 
1895 aa  761    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  100 
 
 
1669 aa  3409    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  39.79 
 
 
1482 aa  905    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  55.8 
 
 
1686 aa  1808    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1536  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  38.52 
 
 
1568 aa  684    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  43.82 
 
 
1590 aa  1280    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  45.25 
 
 
1627 aa  1263    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  37.7 
 
 
1488 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  37.64 
 
 
1299 aa  612  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.63 
 
 
1296 aa  323  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.1 
 
 
1288 aa  311  6.999999999999999e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1017  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.41 
 
 
1270 aa  300  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000312457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2557  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  25.43 
 
 
1946 aa  219  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2558  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  26.65 
 
 
1714 aa  159  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3432  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.92 
 
 
1281 aa  143  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  26.76 
 
 
1014 aa  138  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  26.26 
 
 
991 aa  122  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  24.76 
 
 
1581 aa  108  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  24.83 
 
 
1309 aa  105  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  22.78 
 
 
1544 aa  101  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  23 
 
 
1521 aa  95.1  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  23 
 
 
1521 aa  94.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.61 
 
 
1245 aa  94  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.26 
 
 
1181 aa  90.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.23 
 
 
1030 aa  88.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.37 
 
 
1223 aa  87.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  31.4 
 
 
1069 aa  87  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  21.85 
 
 
1227 aa  86.7  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  21.32 
 
 
1214 aa  86.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  30.35 
 
 
1067 aa  85.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  21.97 
 
 
1493 aa  86.3  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  21.47 
 
 
1225 aa  85.9  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  21.05 
 
 
1215 aa  85.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  21.05 
 
 
1228 aa  84.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  33.74 
 
 
651 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  21.22 
 
 
1158 aa  77.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.32 
 
 
1122 aa  77.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  26.17 
 
 
1200 aa  77.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.17 
 
 
1122 aa  77  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  32.14 
 
 
1838 aa  75.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  22.6 
 
 
1327 aa  75.9  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  32.69 
 
 
656 aa  73.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  32.18 
 
 
648 aa  73.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  22.47 
 
 
1155 aa  72.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  23.81 
 
 
1254 aa  72.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  39.52 
 
 
1676 aa  72  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  32.32 
 
 
1762 aa  72.4  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  35.16 
 
 
1717 aa  70.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  29.64 
 
 
1014 aa  70.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  35.15 
 
 
663 aa  70.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  22.66 
 
 
1273 aa  69.7  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  27.44 
 
 
1323 aa  68.6  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  23.55 
 
 
1169 aa  68.9  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  23.47 
 
 
1169 aa  68.6  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  25.98 
 
 
1470 aa  68.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  36.22 
 
 
1658 aa  67.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0627  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  33.13 
 
 
1722 aa  67  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.33 
 
 
1722 aa  64.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  27.15 
 
 
1223 aa  64.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.33 
 
 
1723 aa  64.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.74 
 
 
1500 aa  62.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  29.65 
 
 
4761 aa  61.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1087  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.45 
 
 
1223 aa  61.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  27.27 
 
 
595 aa  59.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.9 
 
 
1223 aa  58.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  22.92 
 
 
1287 aa  58.2  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  29.27 
 
 
2135 aa  58.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  30.47 
 
 
693 aa  57  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1061  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.15 
 
 
1168 aa  55.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3228  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.46 
 
 
1168 aa  56.2  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1128  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.46 
 
 
1169 aa  55.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0672  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.97 
 
 
1666 aa  55.5  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0705474  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2663  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  24.85 
 
 
1361 aa  55.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1009  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.56 
 
 
1148 aa  55.5  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1179  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.32 
 
 
1204 aa  55.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3477  pilin biogenesis protein-related protein  27.05 
 
 
596 aa  54.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  31.86 
 
 
352 aa  54.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  27.38 
 
 
3925 aa  54.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  32.48 
 
 
1056 aa  53.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1163  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.54 
 
 
1168 aa  53.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.61986  normal  0.837948 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0087  hypothetical protein  22.93 
 
 
1132 aa  53.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  22.55 
 
 
1378 aa  52.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  22.55 
 
 
1378 aa  52.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  23.55 
 
 
1182 aa  52.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  23.54 
 
 
1127 aa  52  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.07 
 
 
1182 aa  51.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2950  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.9 
 
 
1177 aa  51.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.103323  normal  0.178047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.08 
 
 
1186 aa  50.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.37 
 
 
1115 aa  51.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3525  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.25 
 
 
1168 aa  50.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1367  undecaprenol kinase, rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  24.24 
 
 
1212 aa  49.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142333 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  29.87 
 
 
1148 aa  48.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  29.89 
 
 
1111 aa  48.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2716  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.55 
 
 
1190 aa  48.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.31 
 
 
1168 aa  47.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.32 
 
 
1517 aa  47.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1201  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.14 
 
 
1191 aa  47  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113052  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  28.22 
 
 
482 aa  46.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  36.67 
 
 
368 aa  47  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  29.11 
 
 
1785 aa  46.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>