133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2155 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  46.74 
 
 
1895 aa  777    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  35.65 
 
 
1488 aa  640    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1536  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  38.68 
 
 
1568 aa  707    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  55.69 
 
 
1669 aa  1784    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  43.7 
 
 
1590 aa  1303    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  38.67 
 
 
1482 aa  911    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  43.66 
 
 
1627 aa  1263    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  100 
 
 
1686 aa  3425    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  35.36 
 
 
1299 aa  620  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.01 
 
 
1296 aa  345  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.81 
 
 
1288 aa  326  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1017  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.75 
 
 
1270 aa  314  6.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000312457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2557  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  27.51 
 
 
1946 aa  224  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2558  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  26.23 
 
 
1714 aa  179  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3432  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.16 
 
 
1281 aa  157  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  35.63 
 
 
651 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  27.24 
 
 
1014 aa  137  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  27.08 
 
 
991 aa  131  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  35.87 
 
 
656 aa  131  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  25.94 
 
 
1544 aa  127  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  25.58 
 
 
1309 aa  126  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.67 
 
 
1245 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  26.55 
 
 
1581 aa  108  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  35.14 
 
 
693 aa  107  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  24.33 
 
 
1273 aa  99.4  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.15 
 
 
1227 aa  96.7  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  32.16 
 
 
595 aa  95.5  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.74 
 
 
1030 aa  94.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  24.9 
 
 
1521 aa  94.4  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  24.41 
 
 
1521 aa  93.6  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  24.66 
 
 
1493 aa  93.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  31.51 
 
 
4761 aa  92  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  36.65 
 
 
352 aa  90.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  25.23 
 
 
1323 aa  86.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  38.58 
 
 
1762 aa  86.3  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  22.25 
 
 
1215 aa  84.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  22.67 
 
 
1214 aa  84  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.76 
 
 
1181 aa  83.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  22.67 
 
 
1225 aa  84  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  41.53 
 
 
1026 aa  83.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.65 
 
 
1223 aa  81.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  28.88 
 
 
1748 aa  80.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  22.81 
 
 
1228 aa  80.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  22.36 
 
 
1158 aa  80.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.25 
 
 
2002 aa  80.5  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.74 
 
 
2002 aa  79.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.28 
 
 
1723 aa  79  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  39.83 
 
 
635 aa  77.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  23.72 
 
 
1254 aa  77.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0627  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  22.58 
 
 
1722 aa  75.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  31.93 
 
 
648 aa  75.5  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  27.99 
 
 
1069 aa  74.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.19 
 
 
1722 aa  73.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  28.36 
 
 
1067 aa  73.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  31.25 
 
 
1838 aa  73.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  21.73 
 
 
1155 aa  72.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2950  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.45 
 
 
1177 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.103323  normal  0.178047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  36.36 
 
 
2135 aa  70.5  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  32.64 
 
 
663 aa  69.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  32.52 
 
 
482 aa  69.7  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  26.05 
 
 
1470 aa  68.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.55 
 
 
1182 aa  67.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  40.2 
 
 
368 aa  67  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  29.17 
 
 
486 aa  67  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.4 
 
 
1122 aa  67  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.4 
 
 
1122 aa  65.9  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  24.44 
 
 
1200 aa  65.9  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1066  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.43 
 
 
1165 aa  65.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  29.28 
 
 
692 aa  64.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  33.17 
 
 
766 aa  64.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  23.9 
 
 
1169 aa  63.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  24.31 
 
 
1169 aa  62.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  26.13 
 
 
1056 aa  62  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  29.82 
 
 
3925 aa  62  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2663  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  23.11 
 
 
1361 aa  62  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  25 
 
 
1168 aa  61.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  30.81 
 
 
1148 aa  61.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.77 
 
 
1676 aa  61.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  37.31 
 
 
1517 aa  62  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.32 
 
 
1658 aa  61.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3939  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.06 
 
 
1757 aa  61.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  36.67 
 
 
2178 aa  61.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3228  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.07 
 
 
1168 aa  61.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1061  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.07 
 
 
1168 aa  60.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  33.33 
 
 
767 aa  60.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1128  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.07 
 
 
1169 aa  60.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.14 
 
 
2195 aa  59.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.54 
 
 
1717 aa  58.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  23.56 
 
 
1327 aa  58.9  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  28.08 
 
 
1014 aa  58.9  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  24.48 
 
 
1127 aa  58.9  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1009  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.98 
 
 
1148 aa  58.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1163  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.71 
 
 
1168 aa  58.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.61986  normal  0.837948 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0672  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.06 
 
 
1666 aa  57  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0705474  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.7 
 
 
1186 aa  56.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3525  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.58 
 
 
1168 aa  55.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0715  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.84 
 
 
1708 aa  55.5  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.46 
 
 
1223 aa  55.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  24.42 
 
 
1223 aa  54.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.94 
 
 
1872 aa  54.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>