100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3129 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3228  type IV pilin biogenesis protein, putative  86.04 
 
 
1168 aa  2061    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1087  type IV pilin biogenesis protein, putative  47.45 
 
 
1223 aa  1040    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2716  type IV pilin biogenesis protein, putative  49.83 
 
 
1190 aa  1125    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2950  type IV pilin biogenesis protein, putative  50.16 
 
 
1177 aa  1099    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.103323  normal  0.178047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  47.45 
 
 
1223 aa  1041    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3032  type IV pilin biogenesis protein, putative  43.63 
 
 
1216 aa  920    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.765671  normal  0.129147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2883  type IV pilin biogenesis protein, putative  41.73 
 
 
1204 aa  843    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  47.98 
 
 
1223 aa  1042    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  100 
 
 
1168 aa  2375    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0931  type IV pilin biogenesis protein, putative  47.4 
 
 
1201 aa  1053    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207337  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1009  type IV pilin biogenesis protein, putative  47.71 
 
 
1148 aa  981    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1061  type IV pilin biogenesis protein, putative  85.79 
 
 
1168 aa  2055    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  48.79 
 
 
1182 aa  1060    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1179  type IV pilin biogenesis protein, putative  46.76 
 
 
1204 aa  998    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1066  type IV pilin biogenesis protein, putative  49.51 
 
 
1165 aa  1044    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1128  type IV pilin biogenesis protein, putative  85.89 
 
 
1169 aa  2063    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1201  type IV pilin biogenesis protein, putative  50.41 
 
 
1191 aa  1071    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113052  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1090  type IV pilin biogenesis protein, putative  50.7 
 
 
1194 aa  1117    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1163  type IV pilin biogenesis protein, putative  87.24 
 
 
1168 aa  2098    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.61986  normal  0.837948 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3525  type IV pilin biogenesis protein, putative  88.61 
 
 
1168 aa  2083    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  55.65 
 
 
1186 aa  1293    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1367  undecaprenol kinase, rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  47.6 
 
 
1212 aa  1019    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142333 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1216  hypothetical protein  35.79 
 
 
1255 aa  619  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3477  pilin biogenesis protein-related protein  51.25 
 
 
596 aa  594  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  30.16 
 
 
1056 aa  399  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3479  hypothetical protein  42.45 
 
 
596 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03023  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.17 
 
 
1355 aa  343  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3171  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  32.21 
 
 
1364 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  29.94 
 
 
1030 aa  300  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0087  hypothetical protein  26.59 
 
 
1132 aa  267  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2675  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein signal peptide  28.22 
 
 
1070 aa  229  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11870  type IV pilus assembly protein, PilY1-like protein  25.69 
 
 
1036 aa  220  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2911  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  26.63 
 
 
1078 aa  218  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2878  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  27.01 
 
 
1025 aa  216  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421399  normal  0.561571 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5689  type IV fimbrial biogenesis protein PilY  26.26 
 
 
1102 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.180745  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0404  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein signal peptide  26.17 
 
 
1093 aa  207  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2835  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  25.54 
 
 
1041 aa  202  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  25.94 
 
 
991 aa  184  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  24.89 
 
 
1014 aa  179  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0266  putative pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  25.98 
 
 
1324 aa  145  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.388087 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0237  pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  23.25 
 
 
1251 aa  128  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  24.25 
 
 
1544 aa  121  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  22.87 
 
 
1069 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  22.89 
 
 
1014 aa  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.14 
 
 
1245 aa  107  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  24.32 
 
 
1309 aa  105  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  22.61 
 
 
1067 aa  105  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  25.59 
 
 
1581 aa  104  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.25 
 
 
1158 aa  102  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  23.79 
 
 
1200 aa  100  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.21 
 
 
1122 aa  97.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.09 
 
 
1122 aa  94.7  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  23.74 
 
 
1521 aa  92.8  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  23.74 
 
 
1521 aa  92  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  23.36 
 
 
1493 aa  90.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  27.24 
 
 
1155 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  23.13 
 
 
1545 aa  90.1  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  23.81 
 
 
1169 aa  89.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  24.45 
 
 
1169 aa  85.9  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  23.89 
 
 
1273 aa  85.1  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  23.3 
 
 
1174 aa  82  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  23.19 
 
 
1470 aa  82  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.41 
 
 
1227 aa  81.6  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25.36 
 
 
1115 aa  81.3  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.68 
 
 
1288 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  23.62 
 
 
1254 aa  79.3  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.32 
 
 
1296 aa  75.5  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.34 
 
 
1223 aa  71.6  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  26.12 
 
 
1215 aa  66.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  26.12 
 
 
1228 aa  65.9  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  22.07 
 
 
1154 aa  63.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  23.14 
 
 
1225 aa  63.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  23.14 
 
 
1214 aa  62.8  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  21.12 
 
 
1500 aa  62  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25 
 
 
1686 aa  61.6  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.21 
 
 
1482 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.59 
 
 
1723 aa  60.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.59 
 
 
1181 aa  60.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.25 
 
 
1590 aa  58.2  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.29 
 
 
1148 aa  57.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.28 
 
 
1722 aa  57.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  25.95 
 
 
1327 aa  56.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  24.8 
 
 
1111 aa  54.3  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.3 
 
 
1488 aa  54.3  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.6 
 
 
1299 aa  53.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0627  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  22.78 
 
 
1722 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.08 
 
 
1627 aa  52.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  23.43 
 
 
1182 aa  52.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2539  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.11 
 
 
1205 aa  51.6  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  22.26 
 
 
1287 aa  51.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  22.22 
 
 
1378 aa  51.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  23.66 
 
 
1378 aa  51.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5191  FG-GAP repeat-containing protein  21.95 
 
 
798 aa  49.7  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163324  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3432  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.38 
 
 
1281 aa  48.9  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5179  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.89 
 
 
1218 aa  47.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252708  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0672  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.53 
 
 
1666 aa  46.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0705474  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1042  methyltransferase FkbM  32.95 
 
 
550 aa  45.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000399946  hitchhiker  0.00660065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  21.8 
 
 
1577 aa  45.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  22.37 
 
 
1323 aa  45.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2558  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  28.4 
 
 
1714 aa  44.7  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>