58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0237 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0266  putative pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  41.48 
 
 		 1324 aa  873    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.388087 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0237  pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  100 
 
 		 1251 aa  2557    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03023  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.66 
 
 		 1355 aa  169  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  26.05 
 
 		 1056 aa  164  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3171  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  25.09 
 
 		 1364 aa  163  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495041  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.97 
 
 		 1186 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1163  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.23 
 
 		 1168 aa  149  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.61986  normal  0.837948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1128  type IV pilin biogenesis protein, putative  28.32 
 
 		 1169 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3228  type IV pilin biogenesis protein, putative  28 
 
 		 1168 aa  140  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1061  type IV pilin biogenesis protein, putative  28 
 
 		 1168 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3525  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.22 
 
 		 1168 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.12 
 
 		 1168 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0931  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.17 
 
 		 1201 aa  131  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3032  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.51 
 
 		 1216 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.765671  normal  0.129147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1201  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.93 
 
 		 1191 aa  119  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1216  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1255 aa  118  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.77 
 
 		 1030 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2950  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.96 
 
 		 1177 aa  116  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.103323  normal  0.178047 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0087  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1132 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1367  undecaprenol kinase, rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  22.99 
 
 		 1212 aa  115  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142333 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1066  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.68 
 
 		 1165 aa  113  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  23.83 
 
 		 1223 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1009  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.8 
 
 		 1148 aa  112  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.68 
 
 		 1223 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3477  pilin biogenesis protein-related protein  24.15 
 
 		 596 aa  110  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.36 
 
 		 1182 aa  110  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2883  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.65 
 
 		 1204 aa  108  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1087  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.25 
 
 		 1223 aa  108  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1179  type IV pilin biogenesis protein, putative  23 
 
 		 1204 aa  107  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1090  type IV pilin biogenesis protein, putative  23 
 
 		 1194 aa  100  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2835  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  23.61 
 
 		 1041 aa  94.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341777  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5689  type IV fimbrial biogenesis protein PilY  24.29 
 
 		 1102 aa  93.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.180745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2911  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  24.41 
 
 		 1078 aa  92.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2716  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.8 
 
 		 1190 aa  91.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2878  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  24.18 
 
 		 1025 aa  89  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421399  normal  0.561571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2675  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein signal peptide  24.37 
 
 		 1070 aa  87  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0404  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein signal peptide  23.99 
 
 		 1093 aa  81.6  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11870  type IV pilus assembly protein, PilY1-like protein  23.12 
 
 		 1036 aa  72.8  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  23.61 
 
 		 991 aa  64.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  27 
 
 		 1158 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  24.14 
 
 		 1544 aa  62.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1014 aa  60.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  22.2 
 
 		 1155 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.65 
 
 		 1227 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  23.25 
 
 		 1470 aa  56.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  24.17 
 
 		 1521 aa  55.8  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  24.37 
 
 		 1521 aa  55.5  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  21.88 
 
 		 1493 aa  53.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  26.82 
 
 		 1273 aa  52.4  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  24.9 
 
 		 1228 aa  50.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  24.9 
 
 		 1215 aa  50.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  25.31 
 
 		 1214 aa  48.9  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  25.31 
 
 		 1225 aa  48.9  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  23.62 
 
 		 1069 aa  46.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  25.4 
 
 		 1581 aa  46.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.04 
 
 		 1122 aa  45.1  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.07 
 
 		 1223 aa  45.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.04 
 
 		 1122 aa  44.7  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>