87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03023 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3171  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  58.38 
 
 		 1364 aa  1629    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495041  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03023  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  100 
 
 		 1355 aa  2787    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  39.9 
 
 		 1056 aa  529  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1090  type IV pilin biogenesis protein, putative  31.54 
 
 		 1194 aa  352  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  31.93 
 
 		 1168 aa  340  8e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3525  type IV pilin biogenesis protein, putative  31.74 
 
 		 1168 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1128  type IV pilin biogenesis protein, putative  30.62 
 
 		 1169 aa  338  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1179  type IV pilin biogenesis protein, putative  31.3 
 
 		 1204 aa  337  9e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1216  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1255 aa  335  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1061  type IV pilin biogenesis protein, putative  30.5 
 
 		 1168 aa  336  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3228  type IV pilin biogenesis protein, putative  30.5 
 
 		 1168 aa  336  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1163  type IV pilin biogenesis protein, putative  30.38 
 
 		 1168 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.61986  normal  0.837948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  30.99 
 
 		 1186 aa  332  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1367  undecaprenol kinase, rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  29.98 
 
 		 1212 aa  332  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142333 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0931  type IV pilin biogenesis protein, putative  29.85 
 
 		 1201 aa  331  7e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1009  type IV pilin biogenesis protein, putative  31.47 
 
 		 1148 aa  327  7e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  29.38 
 
 		 1223 aa  325  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  29.62 
 
 		 1223 aa  325  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1087  type IV pilin biogenesis protein, putative  29.21 
 
 		 1223 aa  322  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2950  type IV pilin biogenesis protein, putative  29.42 
 
 		 1177 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.103323  normal  0.178047 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2716  type IV pilin biogenesis protein, putative  30.06 
 
 		 1190 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3032  type IV pilin biogenesis protein, putative  30.6 
 
 		 1216 aa  301  8e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.765671  normal  0.129147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1201  type IV pilin biogenesis protein, putative  30.35 
 
 		 1191 aa  294  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2883  type IV pilin biogenesis protein, putative  29.23 
 
 		 1204 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0087  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1132 aa  274  6e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  28.65 
 
 		 1182 aa  274  8.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1066  type IV pilin biogenesis protein, putative  27.7 
 
 		 1165 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3477  pilin biogenesis protein-related protein  33.4 
 
 		 596 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2878  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  28.55 
 
 		 1025 aa  222  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421399  normal  0.561571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  29.11 
 
 		 1030 aa  217  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0404  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein signal peptide  25.85 
 
 		 1093 aa  207  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11870  type IV pilus assembly protein, PilY1-like protein  25.85 
 
 		 1036 aa  202  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2835  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  26.85 
 
 		 1041 aa  202  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341777  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2675  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein signal peptide  25.15 
 
 		 1070 aa  196  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2911  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  26.09 
 
 		 1078 aa  194  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5689  type IV fimbrial biogenesis protein PilY  24.34 
 
 		 1102 aa  185  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.180745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0237  pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  24.63 
 
 		 1251 aa  162  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0266  putative pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  24.9 
 
 		 1324 aa  152  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.388087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1014 aa  122  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.3 
 
 		 1122 aa  116  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  23.72 
 
 		 991 aa  115  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.3 
 
 		 1122 aa  114  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  24.94 
 
 		 1545 aa  100  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  25.51 
 
 		 1521 aa  95.5  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  26.38 
 
 		 1521 aa  95.5  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  21.82 
 
 		 1227 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.58 
 
 		 1158 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25.71 
 
 		 1155 aa  88.6  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  31.03 
 
 		 9585 aa  87.8  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1367 aa  85.1  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3479  hypothetical protein  24.53 
 
 		 596 aa  84  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  29 
 
 		 1493 aa  82.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  24.61 
 
 		 1200 aa  81.6  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  21.99 
 
 		 1169 aa  79.7  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  23.3 
 
 		 1581 aa  79.7  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  24.56 
 
 		 1544 aa  76.3  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  26.2 
 
 		 1254 aa  76.3  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  23.58 
 
 		 1174 aa  74.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1169 aa  74.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  23.81 
 
 		 1470 aa  73.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.06 
 
 		 1245 aa  72  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.25 
 
 		 1181 aa  70.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  21.29 
 
 		 1067 aa  63.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  22.58 
 
 		 1309 aa  63.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  22.49 
 
 		 1287 aa  62.4  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  29.08 
 
 		 1223 aa  60.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  26.32 
 
 		 1214 aa  60.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  26.32 
 
 		 1225 aa  60.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  26.32 
 
 		 1228 aa  60.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  26.32 
 
 		 1215 aa  60.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  21.66 
 
 		 1069 aa  58.9  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2539  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25.96 
 
 		 1205 aa  58.9  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  21.15 
 
 		 1296 aa  58.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  20.73 
 
 		 1378 aa  58.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  22.17 
 
 		 1115 aa  56.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  32.28 
 
 		 1182 aa  54.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.44 
 
 		 1148 aa  53.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  23.2 
 
 		 1273 aa  52.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.45 
 
 		 1500 aa  52.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  21.87 
 
 		 1517 aa  52  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5191  FG-GAP repeat-containing protein  19.96 
 
 		 798 aa  52  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.58 
 
 		 1154 aa  51.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  27.59 
 
 		 1378 aa  50.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  25.1 
 
 		 1327 aa  48.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  21.41 
 
 		 1014 aa  47.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1048  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.82 
 
 		 1149 aa  47.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  28 
 
 		 1323 aa  45.1  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>