110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1765 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  41.65 
 
 
1470 aa  973    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  38.69 
 
 
1581 aa  785    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  41.96 
 
 
1493 aa  970    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  100 
 
 
1521 aa  3133    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  98.82 
 
 
1521 aa  3104    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  29.31 
 
 
1895 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.84 
 
 
1658 aa  353  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0358491  normal  0.103915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0504  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.9 
 
 
1676 aa  348  7e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  33.63 
 
 
1254 aa  343  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3149  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.98 
 
 
1717 aa  325  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.308905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  32.5 
 
 
1327 aa  315  3.9999999999999997e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2557  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  34.05 
 
 
1946 aa  297  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.08 
 
 
1122 aa  290  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.96 
 
 
1122 aa  286  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  32.09 
 
 
1181 aa  273  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  29.56 
 
 
1158 aa  264  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  36.07 
 
 
1155 aa  261  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2558  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  28.24 
 
 
1714 aa  260  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  35.9 
 
 
1223 aa  258  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  32.53 
 
 
1014 aa  255  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  33.2 
 
 
1115 aa  246  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.53 
 
 
1227 aa  238  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  29.27 
 
 
1174 aa  228  7e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  31.3 
 
 
1169 aa  225  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0490  Pyrrolo-quinoline quinone  29.65 
 
 
1545 aa  224  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  30.67 
 
 
1215 aa  224  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  30.51 
 
 
1228 aa  224  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  30.9 
 
 
1169 aa  222  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  29.97 
 
 
1214 aa  220  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  29.97 
 
 
1225 aa  220  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  31.96 
 
 
991 aa  218  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.45 
 
 
1500 aa  206  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  28.55 
 
 
1309 aa  206  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  29.04 
 
 
1014 aa  202  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0815  type IV pilus-associated protein, putative  29.47 
 
 
1067 aa  198  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2539  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  31.76 
 
 
1205 aa  197  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  28.41 
 
 
1148 aa  196  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  33.97 
 
 
1154 aa  195  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0719  type IV pilus-associated protein, putative  28.91 
 
 
1069 aa  194  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677662  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  26.73 
 
 
1544 aa  193  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  33.72 
 
 
1323 aa  192  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.2 
 
 
1517 aa  189  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  32.5 
 
 
1200 aa  187  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5191  FG-GAP repeat-containing protein  30.14 
 
 
798 aa  184  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163324  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  28.64 
 
 
1182 aa  183  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.24 
 
 
1245 aa  181  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  28.64 
 
 
1378 aa  173  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  28.64 
 
 
1378 aa  172  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  28.55 
 
 
1287 aa  172  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  27.8 
 
 
1111 aa  170  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  30.14 
 
 
1273 aa  166  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2663  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  27.02 
 
 
1361 aa  164  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  27.99 
 
 
1127 aa  160  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.65 
 
 
1577 aa  151  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.54 
 
 
1030 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5179  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.22 
 
 
1218 aa  132  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.67 
 
 
1482 aa  108  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.36 
 
 
1488 aa  107  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0718  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein transmembrane  30.05 
 
 
613 aa  106  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27 
 
 
1299 aa  105  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.7 
 
 
1627 aa  100  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3032  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.64 
 
 
1216 aa  100  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.765671  normal  0.129147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1536  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.3 
 
 
1568 aa  98.6  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3477  pilin biogenesis protein-related protein  26.53 
 
 
596 aa  97.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1066  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.74 
 
 
1165 aa  97.1  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0931  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.28 
 
 
1201 aa  95.5  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207337  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1163  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.33 
 
 
1168 aa  95.5  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.61986  normal  0.837948 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03023  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.51 
 
 
1355 aa  95.5  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.23 
 
 
1288 aa  94.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23 
 
 
1669 aa  94.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1009  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.71 
 
 
1148 aa  94.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.35 
 
 
1590 aa  94.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.41 
 
 
1686 aa  93.2  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3171  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  26.86 
 
 
1364 aa  93.2  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495041  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1087  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.09 
 
 
1223 aa  92.8  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1201  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.59 
 
 
1191 aa  92.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113052  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  25.86 
 
 
1223 aa  92  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.591357 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1017  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.67 
 
 
1270 aa  92  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000312457  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1128  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.44 
 
 
1169 aa  91.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1087  undecaprenol kinase., rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  25.34 
 
 
1223 aa  89.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485932  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0087  hypothetical protein  26.83 
 
 
1132 aa  89.4  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.93 
 
 
1186 aa  88.6  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1367  undecaprenol kinase, rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  24.33 
 
 
1212 aa  89  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142333 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3129  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.6 
 
 
1168 aa  86.7  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1216  hypothetical protein  26.91 
 
 
1255 aa  83.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1179  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.43 
 
 
1204 aa  83.2  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.34 
 
 
1296 aa  83.2  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3525  type IV pilin biogenesis protein, putative  25 
 
 
1168 aa  81.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1106  type IV pilin biogenesis protein, putative  22.9 
 
 
1182 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.332365  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1061  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.72 
 
 
1168 aa  79  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3228  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.72 
 
 
1168 aa  79  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2950  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.56 
 
 
1177 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.103323  normal  0.178047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3432  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  22.6 
 
 
1281 aa  76.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2716  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.73 
 
 
1190 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1090  type IV pilin biogenesis protein, putative  24.9 
 
 
1194 aa  70.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0871  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  24.14 
 
 
1056 aa  67.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2883  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.74 
 
 
1204 aa  66.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0404  putative type 4 fimbrial biogenesis pily1-related protein signal peptide  23.85 
 
 
1093 aa  59.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2675  putative type 4 fimbrial biogenesis PILY1-related protein signal peptide  24.31 
 
 
1070 aa  59.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2911  putative type 4 fimbrial biogenesis PilY1-related protein signal peptide  21.21 
 
 
1078 aa  57.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>